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DB11/T 1804-2025 实验动物 繁育与遗传监测
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ICS 65.020.30 CCS B 44 DB11 北 京 市 地 方 标 准 DB11/T 1804—2025 代替 DB11/T 1804—2020 实验动物 繁育与遗传监测 Laboratory animal—Breeding and genetic monitoring 2025-04-01 发布 2025-07-01 实施 北京市市场监督管理局 发 布 == 目 次 == 前言............................................................................................................................................... II 1 范围............................................................................................................................................ 1 2 规范性引用文件.......................................................................................................................... 1 3 术语和定义................................................................................................................................. 1 4 缩略语........................................................................................................................................ 2 5 遗传分类及命名原则................................................................................................................... 2 6 繁殖方法..................................................................................................................................... 4 7 遗传监测..................................................................................................................................... 5 附录 A(规范性) 实验动物微卫星 DNA 标记遗传检测方法............................................................. 8 附录 B(规范性) 实验斑马鱼 SNP 遗传标记的检测方法............................................................... 27 附录 C(规范性) MHC 单倍型实验鸡和实验鸭直接测序检测方法.................................................... 30 参考文献......................................................................................................................................... 35 前 言 本文件按照GB/T 1.1—2020《标准化工作导则 第1部分:标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。 本文件代替DB11/T 1804—2020《实验动物 繁育与遗传监测》,主要技术变化如下: a) 增加了“实验树鼩繁育与遗传监测”相关内容(见 5、6、7、附录 A); b) 近交系实验动物抽样数量(见 7.2.2)。 本文件由北京市科学技术委员会、中关村科技园区管理委员会提出并归口。本文件由北京市科学技术委员会、中关村科技园区管理委员会组织实施。 本文件起草单位:首都医科大学、中国食品药品检定研究院、北京市实验动物管理办公室、中国医学科学院医学实验动物研究所、中国人民解放军军事医学研究院、国家卫生健康委员会科学技术研究所、杭州医学院、吉林大学、中国农业科学院哈尔滨兽医研究所、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所、北京市标准化研究院、北京华阜康生物科技股份有限公司、北京康蓝生物技术有限公司、中国科学院水生生物研究所、北京大学、清华大学、中国医学科学院医学生物学研究所、中国科学院昆明动物研究所。 本文件主要起草人:陈振文、李根平、贺争鸣、李长龙、刘云波、孙德明、岳秉飞、李奎、杨述林、冯书堂、杜小燕、向志光、王洪、董罡、任文陟、陈洪岩、陈继兰、巩薇、冯育芳、郭红刚、王熙、李吏、王锡乐、刘文菊、谢佳琪、樊子风、萨晓婴、刘先菊、丛日旭、腾永康、肖冲、魏杰、于鹏丽、牟玉莲、公维华、张宁波、徐玲玲、崔宗斌、张博、孙荣泽、韩凌霞、常在、刘苗苗、唐倩倩、代解杰、吕龙宝、王文广、王芸、马玉华。 本文件及其所代替文件的历次版本发布情况为: ——首次发布分别为DB11/T 828.3—2011、DB11/T 1053.3—2013、DB11/T 1461.1—2017、DB11/T 1461.2—2017、DB11/T 1461.3—2017、DB11/T 1461.4—2018、DB11/T 1461.5—2018; ——2020年发布为DB11/T 1804—2020; ——本次为第二次修订。 = 实验动物 繁育与遗传监测 = == 1 范围 == 本文件规定了实验动物的遗传分类及命名原则、繁殖方法和遗传检测。 本文件适用于实验小型猪、实验猪、实验牛、实验羊、实验狨猴、实验长爪沙鼠、实验猫、实验雪貂、实验鸡、实验鸭、实验鹅、实验鸽、实验鱼(斑马鱼和剑尾鱼)、实验树鼩的繁育和遗传监测。 == 2 规范性引用文件 == 下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中,注日期的引用文件,仅该日期对应的版本适用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。 GB 14923 实验动物 遗传质量控制 {| class="wikitable" | valign="top" |GB/T | valign="top" |2416 | valign="top" |东北细毛羊 |- | valign="top" |GB/T | valign="top" |3157 | valign="top" |中国荷斯坦牛 |- | valign="top" |GB/T | valign="top" |19166 | valign="top" |中国西门塔尔牛 |- | valign="top" |GB/T | valign="top" |19376 | valign="top" |波尔山羊种羊 |- | valign="top" |GB/T | valign="top" |22283 | valign="top" |长白猪种猪 |- | valign="top" |GB/T | valign="top" |22284 | valign="top" |大约克夏猪种猪 |- | valign="top" |GB/T | valign="top" |22285 | valign="top" |杜洛克猪种猪 |- | valign="top" |GB/T | valign="top" |22909 | valign="top" |小尾寒羊 |- | valign="top" |GB/Z | valign="top" |34792 | valign="top" |实验动物 引种技术规程 |} NY/T 14 高产奶牛饲养管理规范 NY 625 迪卡配套系猪种猪 {| class="wikitable" | valign="top" |NY/T | valign="top" |1339 | valign="top" |肉牛育肥良好管理规范 |- | valign="top" |NY/T | valign="top" |1446 | valign="top" |种公牛饲养管理技术规程 |- | valign="top" |NY/T | valign="top" |1673 | valign="top" |畜禽微卫星DNA遗传多样性检测技术规程 |- | valign="top" |NY/T | valign="top" |1901 | valign="top" |鸡遗传资源保种场保种技术规范 |- | valign="top" |NY/T | valign="top" |2662 | valign="top" |标准化养殖场 奶牛 |- | valign="top" |NY/T | valign="top" |2665 | valign="top" |标准化养殖场 肉羊 |} == 3 术语和定义 == 下列术语和定义适用于本文件。 3.1 实验动物 laboratory animal 经人工饲育,对其携带的微生物和寄生虫实行控制,遗传背景明确或者来源清楚,用于科学研究、 教学、生产和检定以及其他科学实验的动物。 3.2 实验种群 experimental population 以远交方式进行繁殖生产的实验动物群体。 3.3 封闭群 closed colony 不引进外部动物、在群体内随机选择种动物进行繁殖,以维持有限杂合度的实验动物种群。 3.4 近交系 inbred strain 一个动物群体中,任何个体基因组中98.6%以上的座位为纯合的品系。 注:经典近交系经至少连续20代的全同胞兄妹交配培育而成。品系内所有个体都可追湖到起源于第 20 代或以后代 数的一对共同祖先。经连续 20代以上亲子交配与全同胞兄妹交配有等同效果。近交系的近交系数(inbreeding coefficient)大于98.6%。 3.5 单倍型群体 haplotype population 通过近亲交配繁殖方式培育出的单倍体基因型一致的实验动物群体。 3.6 杂交群 hybrids 由两个不同近交系杂交产生的后代群体。 注:子一代简称F1。 == 4 缩略语 == 下列缩略语适用于本文件。 PCR:聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction) SNP: 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism) STR: 短串联重复序列(Short Tandem Repeat) == 5 遗传分类及命名原则 == === 5.1 遗传分类 === 根据不同品种品系动物及个体间遗传差异将实验动物分为实验种群、封闭群、近交系、单倍型群体 和杂交群,具体符合表1的要求。 表1 实验动物遗传分类表 {| class="wikitable" | valign="top" |实验动物群体 | valign="top" |遗传分类 |- | valign="top" |实验长白猪 | rowspan="2" valign="top" |实验种群 |- | valign="top" |实验大约克夏猪 |- | valign="top" |实验杜洛克猪 | rowspan="9" valign="top" | 实验种群 |- | valign="top" |实验中国荷斯坦牛 |- | valign="top" |实验西门塔尔牛 |- | valign="top" |实验波尔山羊 |- | valign="top" |实验小尾寒羊 |- | valign="top" |实验东北细毛羊 |- | valign="top" |实验狨猴 |- | valign="top" |实验猫 |- | valign="top" |实验雪貂 |- | valign="top" |实验长爪沙鼠 | rowspan="9" valign="top" | 封闭群 |- | valign="top" |实验鸡 |- | valign="top" |实验鸭 |- | valign="top" |实验鹅 |- | valign="top" |实验鸽 |- | valign="top" |实验小型猪 |- | valign="top" |实验斑马鱼 |- | valign="top" |实验剑尾鱼 |- | valign="top" |实验树鼩 |- | valign="top" |实验小型猪 | rowspan="3" valign="top" | 近交系 |- | valign="top" |实验斑马鱼 |- | valign="top" |实验剑尾鱼 |- | valign="top" |实验鸡 | rowspan="2" valign="top" |单倍型群体 |- | valign="top" |实验鸭 |} === 5.2 命名原则 === 5.2.1 实验种群 在原有的品种品系名称前面加上实验,如实验长白猪。 5.2.2 封闭群 由2~4个大写英文字母命名。种群名称前标明保持者的英文缩写名称,第一个字母大写,后面的字母小写,宜不超过4个字母。保持者与种群名称之间用冒号分开。 5.2.3 近交系 以大写英文字母或大写英文字母加阿拉伯数字命名,符号应简短。 5.2.4 单倍型群体 以单倍体基因型英文名称(或缩写)加英文字母和阿拉伯数字命名,符号应简短。 5.2.5 杂交群 以雌性亲代名称在前,雄性亲代名称居后,二者之间以大写英文字母“”相连表示杂交。将以上部分用括号括起,再在其后标明杂交的代数(如F1、F2等)。 == 6 繁殖方法 == === 6.1 实验种群 === 6.1.1 引种 选择双亲健康、无遗传疾病、繁殖性能好、体貌符合品种特征的动物作为种用动物。 6.1.2 繁育方法 实验猪按照NY 625的规定进行。 实验西门塔尔牛按照NY/T 1339和NY/T 1446规定执行,实验中国荷斯坦牛按照NY/T 14和NY/T 2662 的规定进行。 实验羊应按照GB 14923和NY/T 2665的规定进行。实验狨猴和雪貂应按GB 14923的规定进行。 实验猫按照雌雄5:1以上比例进行繁殖。 === 6.2 封闭群 === 6.2.1 引种 作为繁殖用种子的封闭群动物应三代以内无共同亲代并符合GB/Z 34792对封闭群种用动物的要求。 封闭群实验长爪沙鼠、实验鸽和实验树鼩引种数量不少于25对。 封闭群实验小型猪引种数量不少于13对(循环交配方式繁殖)或25对(随机交配方式繁殖)。封闭群实验鱼(斑马鱼和剑尾鱼)引种数目不少于100尾。 实验鸡、实验鸭和实验鹅引种规模按照NY/T 1901执行。 其他封闭群实验动物引种规模按照GB 14923规定执行。 6.2.2 繁育方法 封闭群实验小型猪、实验长爪沙鼠、实验鸽和实验树鼩繁殖方法按照GB 14923的规定执行。实验鸡、实验鸭、实验鹅应按照NY/T 1901的规定进行。 === 6.3 近交系 === 6.3.1 引种 作为繁殖用种子的近交系动物应符合GB/Z 34792对近交系种用动物的要求。 6.3.2 繁育方法 近交系实验动物可分为基础群(foundation stock)、血缘扩大群(pedigree expansion stock)和生产群(production stock),当近交系动物生产供应数量不是很大时,可不设血缘扩大群,仅设基础群和生产群。各基础群、血缘扩大群和生产群的繁育方式按照GB 14923执行。 === 6.4 单倍型群体 === 6.4.1 引种 作为繁殖用种子的单倍型群体动物按照GB/Z 34792的规定执行。 6.4.2 繁育方法 以全同胞或半同胞兄妹交配方式进行。 === 6.5 杂交群 === 将不同品系实验动物的亲代雌性与亲代雄性杂交,即可得到F1实验动物。 == 7 遗传监测 == === 7.1 遗传要求 === 遗传满足以下要求: ——体貌符合品种特征; ——谱系记录清楚; ——繁殖方法科学; ——群体遗传符合品种特征; ——遗传质量检测合格。 === 7.2 遗传检测 === 7.2.1 检测频率 每12个月至少进行一次检测。 7.2.2 抽样 7.2.2.1 实验种群和封闭群抽样数量 从每个种群中随机抽取非同窝成年实验动物的血液或其他组织,雌雄各半。抽样数量按照表2规定执行。 表2 实验种群和封闭群遗传检测抽样数量 {| class="wikitable" | valign="top" |群体大小(只/头/羽) | valign="top" |抽样数量(只/头/羽) |- | valign="top" |<100 | valign="top" |≥15 |- | valign="top" |≥100 | valign="top" |≥30 |} 7.2.2.2 近交系实验动物抽样数量 基础群留种动物的双亲均应进行遗传检测;各生产群体采取随机抽取非同窝成年动物雌雄各半,抽样数量按照表3规定执行。一般不超过 30只。 表3 近交系实验动物遗传检测抽样数量 {| class="wikitable" | valign="top" |群体大小(只/头/羽/尾) | valign="top" |抽样数量(只/头/羽/尾) |- | valign="top" |<100 | valign="top" |≥6 |- | valign="top" |≥100 | valign="top" |≥群体数量×6% |} 7.2.3 遗传检测方法 采用群体遗传结构评估、微卫星DNA标记、SNP分子标记和直接测序等检测方法,在有检测能力的实验室进行,具体按照表4规定执行。 表4 遗传检测方法适用实验动物群体 {| class="wikitable" | valign="top" |实验动物群体 | valign="top" |遗传分类 | valign="top" |检测方法 | valign="top" |执行标准或方法 |- | valign="top" |实验长白猪 | rowspan="11" valign="top" | 实验种群 | rowspan="8" valign="top" | 群体遗传结构评估 | valign="top" |按照 GB/T 22283 的规定执行 |- | valign="top" |实验大约克夏猪 | valign="top" |按照 GB/T 22284 的规定执行 |- | valign="top" |实验杜洛克猪 | valign="top" |按照 GB/T 22285 的规定执行 |- | valign="top" |实验中国荷斯坦牛 | valign="top" |按照 GB/T 3157 的规定执行 |- | valign="top" |实验西门塔尔牛 | valign="top" |按照 GB/T 19166 的规定执行 |- | valign="top" |实验波尔山羊 | valign="top" |按照 GB/T 19376 的规定执行 |- | valign="top" |实验小尾寒羊 | valign="top" |按照 GB/T 22909 的规定执行 |- | valign="top" |实验东北细毛羊 | valign="top" |按照 GB/T 2416 的规定执行 |- | valign="top" |实验狨猴 | rowspan="13" valign="top" | 微卫星 DNA 标记检测法 | rowspan="13" valign="top" | 按照附录 A 的规定执行 |- | valign="top" |实验猫 |- | valign="top" |实验雪貂 |- | valign="top" |实验长爪沙鼠 | rowspan="9" valign="top" | 封闭群 |- | valign="top" |实验鸡 |- | valign="top" |实验鸭 |- | valign="top" |实验鹅 |- | valign="top" |实验鸽 |- | valign="top" |实验小型猪 |- | valign="top" |实验斑马鱼 |- | valign="top" |实验剑尾鱼 |- | valign="top" |实验树鼩 |- | valign="top" |实验小型猪 | rowspan="3" valign="top" | 近交系 |- | valign="top" |实验斑马鱼 | rowspan="2" valign="top" |SNP 分子标记检测法 | rowspan="2" valign="top" |按照附录 B 的规定执行 |- | valign="top" |实验剑尾鱼 |- | valign="top" |实验鸡 | rowspan="2" valign="top" |单倍型群体 | rowspan="2" valign="top" |直接测序检测法 | rowspan="2" valign="top" |按照附录 C 的规定执行 |- | valign="top" |实验鸭 |} 7.2.4 结果判定 7.2.4.1 实验种群检测结果判定 7.2.4.1.1 群体遗传结构评估 当实验猪、实验牛、实验羊体貌特征与品种品系特征相符合时,判定合格,否则判定不合格。 7.2.4.1.2 微卫星 DNA 标记检测法 实验狨猴、实验猫和实验雪貂适用于微卫星DNA标记检测法,具体按照附录A规定执行。 7.2.4.2 封闭群实验检测结果判定 封闭群实验长爪沙鼠、实验鸡、实验鸭、实验鹅、实验鹅、实验小型猪、实验鱼(斑马鱼和剑尾鱼)和实验树鼩采用微卫星DNA标记检测法,具体按照附录A规定执行 7.2.4.3 单倍型群体检测结果判定 单倍型实验鸡和实验鸭采用聚合酶链式反应(PCR)产物直接测序法,具体按照附录C规定执行。 7.2.4.4 近交系检测结果判定 7.2.4.4.1 微卫星 DNA 标记检测法 近交系实验小型猪采用微卫星DNA标记检测法,具体按照附录A规定执行。 7.2.4.4.2 SNP 分子标记检测法 近交系实验鱼采用SNP分子标记检测法,具体按照附录B规定执行。 附 录 A (规范性) 实验动物微卫星 DNA 标记遗传检测方法 A.1 基因组DNA的提取 基因组DNA提取方法按照NY/T 1673的规定执行。 A.2 微卫星位点 A.2.1 用于检测封闭群和近交系实验小型猪遗传质量的微卫星位点分别为25个和10个,各微卫星位点的名称、染色体位置、引物序列、等位基因数、等位基因范围和退火温度按照表A.1的规定执行。 表A.1 实验小型猪微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |所在染色 体 | valign="top" |Mg2+浓度 (mM) | valign="top" |退火温度 (℃) | valign="top" |等位基 因数 | valign="top" |等位基因 范围 | valign="top" |适用群体 |- | valign="top" |SW974 | valign="top" |GGTGAAGTTTTTGCTTTGAACC GAAAGAAATCCAAATCCAAACC | valign="top" |1 | valign="top" |2.0 | valign="top" |58 | valign="top" |17 | valign="top" |129~175 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |S0091 | valign="top" |TCTACTCCAGGAGATAAGCCAGAT CAGTGACTCCATGCACAGTTATGA | valign="top" |2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 | valign="top" |14 | valign="top" |96~174 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW240 | valign="top" |AGAAATTAGTGCCTCAAATTGG AAACCATTAAGTCCCTAGCAAA | valign="top" |2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 | valign="top" |11 | valign="top" |92~114 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW1066 | valign="top" |GCAGGATGAACCACCCTG CTCTTGAGGCAACCTGCTG | valign="top" |3 | valign="top" |2.0 | valign="top" |60 | valign="top" |19 | valign="top" |166~214 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW1089 | valign="top" |TTTTCCCCTTCACTCACCC GATCAAAGTCCCTTACTCCGG | valign="top" |4 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 | valign="top" |10 | valign="top" |142~190 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |S0005 | valign="top" |TCCTTCCCTCCTGGTAACTA GCACTTCCTGATTCTGGGTA | valign="top" |5 | valign="top" |2.0 | valign="top" |54 | valign="top" |11 | valign="top" |204~244 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW1057 | valign="top" |TCCCCTGTTGTACAGATTGATG TCCAATTCCAAGTTCCACTAGC | valign="top" |6 | valign="top" |2.0 | valign="top" |58 | valign="top" |14 | valign="top" |142~191 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW632 | valign="top" |TGGGTTGAAAGATTTCCCAA GGAGTCAGTACTTTGGCA | valign="top" |7 | valign="top" |2.0 | valign="top" |54 | valign="top" |9 | valign="top" |148~173 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |OPN | valign="top" |CCAATCCTATTCACGAAAAAGC CAACCCACTTGCTCCCAC | valign="top" |8 | valign="top" |2.0 | valign="top" |59 | valign="top" |12 | valign="top" |138~170 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW29 | valign="top" |AGGGTGGCTAAAAAAGAAAAGG ATCAAATCCTTACCTCTGCAGC | valign="top" |8 | valign="top" |2.0 | valign="top" |61 | valign="top" |12 | valign="top" |133~187 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW911 | valign="top" |CTCAGTTCTTTGGGACTGAACC CATCTGTGGAAAAAAAAAGCC | valign="top" |9 | valign="top" |2.0 | valign="top" |60 | valign="top" |14 | valign="top" |151~178 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW511 | valign="top" |AAGCAGGAATCCCTGCATC CCCAGCCACCAGTCTGAC | valign="top" |9 | valign="top" |1.5 | valign="top" |62 | valign="top" |12 | valign="top" |161~196 | valign="top" |封闭群 |} 表 A.1 实验小型猪微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |所在染色 体 | valign="top" |Mg2+浓度 (mM) | valign="top" |退火温度 (℃) | valign="top" |等位基 因数 | valign="top" |等位基因 范围 | valign="top" |适用群体 |- | valign="top" |SWr158 | valign="top" |TCCAATTCAACTCCTGGCTC GAATGTGCACATACCACATGC | valign="top" |10 | valign="top" |2.0 | valign="top" |60 | valign="top" |18 | valign="top" |158~200 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW951 | valign="top" |TTTCACAACTCTGGCACCAG GATCGTGCCCAAATGGAC | valign="top" |10 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 | valign="top" |14 | valign="top" |108~142 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW271 | valign="top" |TTCCAGTGGCTTTCTGTGC CATTCATTCCCAGTGAAACTTG | valign="top" |11 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 | valign="top" |13 | valign="top" |111~144 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |S0386 | valign="top" |TCCTGGGTCTTATTTTCTA TTTTTATCTCCAACAGTAT | valign="top" |11 | valign="top" |2.0 | valign="top" |48 | valign="top" |12 | valign="top" |155~178 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |S0068 | valign="top" |CCTTCAACCTTTGAGCAAGAAC AGTGGTCTCTCTCCCTCTTGCT | valign="top" |13 | valign="top" |2.0 | valign="top" |62 | valign="top" |10 | valign="top" |210~256 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SWr1008 | valign="top" |ACAGCCACCAACAGTGTTTG GAACTTCCATATGCTGCAAGTG | valign="top" |13 | valign="top" |2.0 | valign="top" |62 | valign="top" |16 | valign="top" |98~256 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |S0007 | valign="top" |TTACTTCTTGGATCATGTC GTCCCTCCTCATAATTTCTG | valign="top" |14 | valign="top" |2.0 | valign="top" |54 | valign="top" |15 | valign="top" |142~192 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW857 | valign="top" |TGAGAGGTCAGTTACAGAAGACC GATCCTCCTCCAAATCCCAT | valign="top" |14 | valign="top" |2.0 | valign="top" |58 | valign="top" |16 | valign="top" |129~173 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SWr312 | valign="top" |ATCCGTGCGTGTGTGCAT CTGGTGGCTACAGTTCCGAT | valign="top" |15 | valign="top" |1.5 | valign="top" |64 | valign="top" |11 | valign="top" |116~136 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SW81 | valign="top" |GATCTGGTCCTGCACAGGG GGGGCTCTCAGGAAGGAG | valign="top" |16 | valign="top" |1.5 | valign="top" |60 | valign="top" |8 | valign="top" |128~144 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |SWr1120 | valign="top" |CAAATGGAACCCATTACAGTCC ACTCCTAGCCCAGGAGCTTC | valign="top" |17 | valign="top" |1.5 | valign="top" |60 | valign="top" |11 | valign="top" |147~178 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |S0062 | valign="top" |AAGATCATTTAGTCAAGGTCACAG TCTGATAGGGAACATAGGATAAAT | valign="top" |18 | valign="top" |2.0 | valign="top" |56 | valign="top" |12 | valign="top" |144~204 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |S0218 | valign="top" |GTGTAGGCTGGCGGTTGT CCCTGAAACCTAAAGCAAAG | valign="top" |X | valign="top" |1.5 | valign="top" |54 | valign="top" |11 | valign="top" |158~196 | valign="top" |封闭群 |- | valign="top" |CGA | valign="top" |ATAGACATTATGTAAGTTGCTGAT GAACTTTCACATCCCTAAGGTCGT | valign="top" |1q | valign="top" |2.5 | valign="top" |55 | valign="top" |12 | valign="top" |250~320 | valign="top" |近交系 |- | valign="top" |SW240 | valign="top" |AGAAATTAGTGCCTCAAATTGG AAACCATTAAGTCCCTAGCAAA | valign="top" |2P | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 | valign="top" |8 | valign="top" |96~115 | valign="top" |近交系 |- | valign="top" |SW72 | valign="top" |ATCAGAACAGTGCGCCGT GTTTGAAAATGGGGTGTTTCC | valign="top" |3P | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 | valign="top" |8 | valign="top" |100~116 | valign="top" |近交系 |- | valign="top" |S0005 | valign="top" |TCCTTCCCTCCTGGTAACTA GCACTTCCTGATTCTGGGTA | valign="top" |5q | valign="top" |3.0 | valign="top" |55 | valign="top" |10 | valign="top" |205~248 | valign="top" |近交系 |- | valign="top" |S0090 | valign="top" |CCAAGACTGCCTTGTAGGTGAATA GCTATCAAGTATTGTACCATTAGG | valign="top" |12q | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 | valign="top" |4 | valign="top" |244~251 | valign="top" |近交系 |- | valign="top" |SW769 | valign="top" |GGTATGACCAAAAGTCCTGGG TCTGCTATGTGGGAAGAATGC | valign="top" |13 | valign="top" |3.0 | valign="top" |55 | valign="top" |7 | valign="top" |106~140 | valign="top" |近交系 |} 表 A.1 实验小型猪微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |所在染色 体 | valign="top" |Mg2+浓度 (mM) | valign="top" |退火温度 (℃) | valign="top" |等位基 因数 | valign="top" |等位基因 范围 | valign="top" |适用群体 |- | valign="top" |SW857 | valign="top" |TGAGAGGTCAGTTACAGAAGACC GATCCTCCTCCAAATCCCAT | valign="top" |14 | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 | valign="top" |6 | valign="top" |144~160 | valign="top" |近交系 |- | valign="top" |S0355 | valign="top" |TCTGGCTCCTACACTCCTTCTTGATG GTTTGGGTGGGTGCTGAAAAATAGGA | valign="top" |15 | valign="top" |3.0 | valign="top" |55 | valign="top" |14 | valign="top" |243~277 | valign="top" |近交系 |- | valign="top" |SW24 | valign="top" |CTTTGGGTGGAGTGTGTGC ATCCAAATGCTGCAAGCG | valign="top" |17 | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 | valign="top" |8 | valign="top" |96~121 | valign="top" |近交系 |- | valign="top" |S0218 | valign="top" |GTGTAGGCTGGCGGTTGT CCCTGAACCCTAAAGCAAAG | valign="top" |X | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 | valign="top" |8 | valign="top" |164~184 | valign="top" |近交系 |} A.2.2 用于检测实验狨猴遗传质量的微卫星位点为20个,各微卫星位点的名称、引物序列、等位基因 数、等位基因范围和退火温度按照表A.2的规定执行。 表A.2 实验狨猴微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因分布范围 |- | valign="top" |CAJA1 | valign="top" |GAAGACGGGGGCGTAAATA TGTGGTGGCTCATACCTGAA | valign="top" |60 | valign="top" |9 | valign="top" |386~402 |- | valign="top" |CAJA6 | valign="top" |GAGCACCAAGATTGGCATTT CCAATACACATCGGCTTTGA | valign="top" |60 | valign="top" |6 | valign="top" |235~243 |- | valign="top" |CAJA10 | valign="top" |ACCCTACATTGCCAAATTGC GCCTCTTCTGAGGGAAGTGA | valign="top" |60 | valign="top" |6 | valign="top" |198~208 |- | valign="top" |CAJA11 | valign="top" |CGAAAGTGTGCTCAACAGGA AAGGTGGGATTCTGAAAGCA | valign="top" |60 | valign="top" |5 | valign="top" |254~262 |- | valign="top" |CAJA13 | valign="top" |AGCACATGAACACCCAGGTT AGTGAAAACAGGCTGGGAGA | valign="top" |60 | valign="top" |6 | valign="top" |378~390 |- | valign="top" |CAJA14 | valign="top" |AGCACATGAACACCCAGGTT AGTGAAAACAGGCTGGGAGA | valign="top" |60 | valign="top" |6 | valign="top" |216~232 |- | valign="top" |CAJA17 | valign="top" |GGGCACTCCAAGGTCAGTAA TTGCCCCCTGCTTATTGTAG | valign="top" |60 | valign="top" |10 | valign="top" |382~400 |- | valign="top" |CAJA18 | valign="top" |ACTTGCAGGCCAGTGTTCTT TGGACAGCTGAGGTTTCCTT | valign="top" |63 | valign="top" |8 | valign="top" |315~329 |- | valign="top" |D10qham51 | valign="top" |CGGGAATTCAAAGGCGTTCT AGGAGGATTTCGCATTTGGG | valign="top" |60 | valign="top" |6 | valign="top" |103~117 |- | valign="top" |Ham157 | valign="top" |CAGCCAACATGCTTCTCAGT GGTGGAATAAATCAGGCTACCAG | valign="top" |60 | valign="top" |6 | valign="top" |193~205 |- | valign="top" |Ham60 | valign="top" |TGCTCTAGAGGTTCCACTCTG GGCATGTTACCTAACCTCTCTG | valign="top" |58 | valign="top" |8 | valign="top" |139~165 |- | valign="top" |Ham65 | valign="top" |TGAGAACGACTGCTCTAGGT TGGAAGTGGCTTCATTCCTG | valign="top" |58 | valign="top" |10 | valign="top" |177~201 |} 表 A.2 实验狨猴微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因分布范围 |- | valign="top" |Ham181 | valign="top" |CAATGAGATGTGTCCAAGTGAG CCAAACACCCAATATGCAGT | valign="top" |58 | valign="top" |7 | valign="top" |213~239 |- | valign="top" |Ham184 | valign="top" |GGCGCAGCTCATCTCTTCAC CCTCCCCAGCATCTTCAAGAC | valign="top" |63 | valign="top" |7 | valign="top" |150~172 |- | valign="top" |Ham125 | valign="top" |GTGGGTAAATGCTGCCATCT GTTTCAACTCCTGCGTCTAGTC | valign="top" |59 | valign="top" |8 | valign="top" |187~201 |- | valign="top" |Ham101 | valign="top" |AGACCAAGCATCTTCTTGGAC CACCTTTAAACTGCTGTGGTTG | valign="top" |59 | valign="top" |6 | valign="top" |281~297 |- | valign="top" |Ham61 | valign="top" |CAAAGATGCTTGGGGATGGA AAGATCTTGCAGGGCGTAAG | valign="top" |61 | valign="top" |10 | valign="top" |263~287 |- | valign="top" |Ham32 | valign="top" |GCCCAAATCCTGTTTGACAC CCACCTAGATCATCGAGAGTAG | valign="top" |58 | valign="top" |7 | valign="top" |183~199 |- | valign="top" |Ham100 | valign="top" |GACCAACTCCAAAGCTAGCA GGTAACATGCTCTCGACCTT | valign="top" |58 | valign="top" |8 | valign="top" |244~262 |- | valign="top" |Ham26 | valign="top" |GCAAATTCGTGAAGCATTCC AACAGTTGGATGAGTTCCAG | valign="top" |59 | valign="top" |8 | valign="top" |182~206 |} A.2.3 用于检测实验长爪沙鼠遗传质量的微卫星位点为28个,各微卫星位点的名称、引物序列、等位 基因数、等位基因范围和退火温度按照表A.3的规定执行。 表A.3 实验长爪沙鼠微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因分布范围 |- | valign="top" |AF200942 | valign="top" |CAGGCACCCCCAGTTT GTCTACACAGGCTGAGGATGT | valign="top" |54 | valign="top" |15 | valign="top" |180~215 |- | valign="top" |AF200943 | valign="top" |GGCTCCTGATTCTACATTTCT CAACCATTGGCAACTCTC | valign="top" |57 | valign="top" |17 | valign="top" |154~181 |- | valign="top" |AF200944 | valign="top" |GCTGGGCTTTAATGTTTATTT GGTGGCTCACACTTTCTGT | valign="top" |54 | valign="top" |19 | valign="top" |113~134 |- | valign="top" |AF200946 | valign="top" |TTTCTGGGGTCTCTTTCTCTC CCATTCTGCAAGACTCCTCT | valign="top" |57 | valign="top" |28 | valign="top" |195~242 |- | valign="top" |AF200945 | valign="top" |AGTCCCTATTACATCCACAAG TTATCCTGCAAAGCCTAAG | valign="top" |57 | valign="top" |12 | valign="top" |166~186 |- | valign="top" |AF200941 | valign="top" |TGGGTCCTTTGGAAGA TGGCTTAAAATGAATCACTTA | valign="top" |55 | valign="top" |24 | valign="top" |115~153 |- | valign="top" |AF200947 | valign="top" |GACAGAGTGGGAGGGGTATGT TGGCAAGTTTGGTTTGTTTGA | valign="top" |55 | valign="top" |17 | valign="top" |188~212 |- | valign="top" |D16Mit7 | valign="top" |CTGCCACCCCTGAACCATTA CTACAAGATGTGGGGCATGA | valign="top" |52.6 | valign="top" |15 | valign="top" |480~529 |- | valign="top" |D16Mit26 | valign="top" |CAGGAATAAAGTATAATGGGGTGC CCCATGATCAGTTGGGTTTT | valign="top" |49.1 | valign="top" |9 | valign="top" |207~266 |} 表 A.3 实验长爪沙鼠微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因分布范围 |- | valign="top" |D1Mit362 | valign="top" |TGTGTGACTGCTTGGAAGATG CTGAGTCCCTAAAGTTGTCCTTG | valign="top" |50.0 | valign="top" |16 | valign="top" |476~504 |- | valign="top" |D8Mit184 | valign="top" |GTTTTTCTCAGAAGAATGCAATATACC TGAGAAGAATGAGGAATTTGTCC | valign="top" |48.1 | valign="top" |11 | valign="top" |196~229 |- | valign="top" |D7Mit33 | valign="top" |TCTGAAGTTTGAATGGTTGTGG TTTCAAAATCGTGTCATTTTGC | valign="top" |47.3 | valign="top" |15 | valign="top" |376~394 |- | valign="top" |D6Mit37 | valign="top" |AAAGAATTGCACATCCACTGG TGCCCAGGATGTTTAAGAGG | valign="top" |47.0 | valign="top" |14 | valign="top" |246~265 |- | valign="top" |D5Mit31 | valign="top" |TCAGGGCTCTCTAAGGGACA ACTATGCAGCCACCAAATCC | valign="top" |53.1 | valign="top" |9 | valign="top" |318~350 |- | valign="top" |D12Mit201 | valign="top" |CCACTGGATGGCAACAGAC TATGTGTTTCAAAACCACACTCG | valign="top" |53.1 | valign="top" |18 | valign="top" |245~283 |- | valign="top" |D2Mit22 | valign="top" |GCTCCCTTTCCTCTTGAACC GGGCCCTTATTCTATCTCCC | valign="top" |49.1 | valign="top" |9 | valign="top" |173~192 |- | valign="top" |D15Mit124 | valign="top" |AGGAGAGAACCAACTGCTGC GGCCAGTGATGACTTTATAATGC | valign="top" |59.8 | valign="top" |17 | valign="top" |232~258 |- | valign="top" |D11Mit36 | valign="top" |CCAGAACTTTTGCTGCTTCC GTGAGCCCTAGGTCCAGTGA | valign="top" |58.7 | valign="top" |15 | valign="top" |234~256 |- | valign="top" |D7Mit71 | valign="top" |CCACCTGGAATACATGTAACCC TAAGATCCAAGAGATGGGTTAAGC | valign="top" |49.1 | valign="top" |11 | valign="top" |165~200 |- | valign="top" |D2Mit76 | valign="top" |CTCAAGTCTCACTTCTCTGCACA ACACCCAAGGTTGACCTCTG | valign="top" |47.3 | valign="top" |19 | valign="top" |281~328 |- | valign="top" |D3Mit130 | valign="top" |AACACATGAAACGTGTGCGT TGATAGGCATGCTTAAGCCC | valign="top" |50.6 | valign="top" |11 | valign="top" |213~251 |- | valign="top" |D19Mit1 | valign="top" |AATCCTTGTTCACTCTATCAAGGC CATGAAGAGTCCAGTAGAAACCTC | valign="top" |49.1 | valign="top" |15 | valign="top" |133~165 |- | valign="top" |D11Mit35 | valign="top" |AGTAACATGGAACATCGACGG TGCTCAGCTCTGGAGTGCTA | valign="top" |48.1 | valign="top" |13 | valign="top" |287~307 |- | valign="top" |D17Mit38 | valign="top" |CCTCTGAGGAGTAACCAAGCC CACAGAGTTCTACCTCCAACCC | valign="top" |52.6 | valign="top" |14 | valign="top" |195~251 |- | valign="top" |DXMit17 | valign="top" |CCTGTTTGGGCACCTAGATT TAATAACCCATGTTTTCTGTGGG | valign="top" |48.1 | valign="top" |9 | valign="top" |234~251 |- | valign="top" |D8Mit56 | valign="top" |ACACTCAGAGACCATGAGTACACC GAGTTCACTACCCACAAGTCTCC | valign="top" |50.6 | valign="top" |9 | valign="top" |100~126 |- | valign="top" |D10Mit66 | valign="top" |TCTCCTTGGAATTCACAGCC GACATTCCTTAAGAGAGACAGTCC | valign="top" |54.7 | valign="top" |14 | valign="top" |272~298 |- | valign="top" |D13Mit1 | valign="top" |TCATTCAACATTCTGTCAATCG CACAACAAGGTTAACCTCTAGACA | valign="top" |49.0 | valign="top" |14 | valign="top" |104~132 |} A.2.4 用于检测封闭群实验雪貂遗传质量的微卫星位点为21个,各微卫星位点的名称、引物序列、重复等位基因数按照表A.4的规定执行。 表A.4 实验雪貂微卫星位点的引物序列、等位基因数及等位基因分布范围 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |等位基因分布范围 | valign="top" |重复等位基因数 |- | valign="top" |Mpu A4w1 | valign="top" |CACTTCCTCCCATGGACACT CAAAGTCTCCCACCCTATGC | valign="top" |152~174 | valign="top" |(AC)23 |- | valign="top" |Mpu A10w4 | valign="top" |TGGCCTATATGTGCAGATGAC TGTTTGTCTTGTACCCTCTGACC | valign="top" |154~158 | valign="top" |(AC)13(AC)7 |- | valign="top" |Mpu A121w7 | valign="top" |ACTGCCATCAGGTCATCTAGG GGGTAGACACCTGGCTCAAG | valign="top" |105~129 | valign="top" |(CA)14 |- | valign="top" |Mpu A129w7 | valign="top" |GGCCTCTGAACACATAGTTG AAGTACAGAATGGAAGGATCTG | valign="top" |197~205 | valign="top" |(CA)13 |- | valign="top" |Mpu A212w1 | valign="top" |CCCTATGAGGGCATGTTTGT CTGCCATGTTTCCACTGGT | valign="top" |137~153 | valign="top" |(TG)13 |- | valign="top" |Mpu A223w3 | valign="top" |GAAGACAGCACCCCAGAGTC T GGTTGCCAAGAACTAGCAG | valign="top" |213~239 | valign="top" |(GT)19 |- | valign="top" |Mpu A229w4 | valign="top" |GGGTAGGACGTGCTTAAAGATG AGCCCTCAAAGCCTCTTCTC | valign="top" |107~139 | valign="top" |(GT)11(TG)7 |- | valign="top" |Mpu A231w6 | valign="top" |CCTCTGGTAACCATCTGTTTG TCTTCAAGATGTTCAGTGTGGA | valign="top" |182~224 | valign="top" |(GT)15 |- | valign="top" |Mpu B1w4 | valign="top" |TCCACTACCTGGCCTCATTC ACCTCAGGCTCCACTCTCAG | valign="top" |178~190 | valign="top" |(CT)15(CA)8 (AC)5(AC)11 |- | valign="top" |Mpu B6w2 | valign="top" |T GGGTGTAGAGCATGTTTGG TGCCTATTCCAGGTACCTCAT | valign="top" |156~164 | valign="top" |(TC)18 |- | valign="top" |Mpu B9w7 | valign="top" |CGTTACCAACTGTGGCTGTG TGCCTGGGCCTGTGATTA | valign="top" |180~192 | valign="top" |(GA)18 |- | valign="top" |Mpu B12w3 | valign="top" |AGTCGACAGATGAGTCCACGAAG TGTCACACATGGCAGGATCT | valign="top" |175~179 | valign="top" |(AG)11(AC)8(AC)7 |- | valign="top" |Mpu B112w5 | valign="top" |CCATTACAAGTGCTTGGAGACA TGGAACATGCTGGAAATTGT | valign="top" |161~165 | valign="top" |(AG) 14 |- | valign="top" |Mpu B202w3 | valign="top" |TCTCCTCCTCCTCCTCCTTC ATGAGATTGACCGTGCATCA | valign="top" |164~168 | valign="top" |(CTC)5(GA)14 |- | valign="top" |Mpu B209w2 | valign="top" |TGCTTCTCCCTCTGACTGCT CCGCCCAAGTATCCCTAAAT | valign="top" |119~125 | valign="top" |(CT)16 |- | valign="top" |Mpu B217w3 | valign="top" |TTCCCTGCTTGTGCTCTCTT TGGGGTAAGGGTAGGTATGC | valign="top" |126~144 | valign="top" |(TC)5(TC)17 |- | valign="top" |Mpu C4w7 | valign="top" |CTGGCCCTATCACATACATATTCA GGAAGTATACTCATGCCTGCAA | valign="top" |147~163 | valign="top" |(TCCA)9 |- | valign="top" |Mpu C102w3 | valign="top" |GGGTGGATGGGTGAGTAGGTA CCTTCCCACATTCCATCCTT | valign="top" |119~135 | valign="top" |(TGGA)7 |} 表 A.4 实验雪貂微卫星位点的引物序列、等位基因数及等位基因分布范围(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |等位基因分布范围 | valign="top" |重复等位基因数 |- | valign="top" |Mpu D207w5 | valign="top" |CAGGTGAAGAAGTCCCTCTGT CTTGGTTCTGACCATTTGGA | valign="top" |188~214 | valign="top" |(CT)10(ATAG)7 |- | valign="top" |Mpu D209w4 | valign="top" |GAACAGCAAGTAGTCCAACTCTCA GTTGGATCCTTTCCATCACC | valign="top" |165~185 | valign="top" |(TATC)7 |- | valign="top" |Mpu D231w2 | valign="top" |TTTGGGTTCCACAGTAGGTG ATGCTCTCAATCCATGCTCA | valign="top" |132~160 | valign="top" |(GATA)9 |} A.2.5 用于检测实验猫遗传质量的微卫星位点为37个,各微卫星位点的名称、染色体位置、引物序列、 退火温度按照表A.5的规定执行。 表A.5 实验猫微卫星位点的扩增条件和染色体分布 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |染色体 | valign="top" |Mg2+浓度(mM) | valign="top" |退火温度(℃) |- | valign="top" |FCA123 | valign="top" |CTTCACACTGCGAGAGGACT TCTGACAGGCTCCAGGTTACT | valign="top" |A1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |57 |- | valign="top" |FCA1062 | valign="top" |CTTCACACTGCGAGAGGACT TCTGACAGGCTCCAGGTTACT | valign="top" |A1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA522 | valign="top" |GTTTGAAATTATGGCTTCCCAACT TCTGGAGAACAAGAGGGAAAAGT | valign="top" |B1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |54 |- | valign="top" |FCA275 | valign="top" |TCACTCCTGGACTTAACCATCAG TGCTATTGACGAAGGGGCAG | valign="top" |B2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |57 |- | valign="top" |FCA848 | valign="top" |CTCCTTCACCAAAGGCTGGAT GGACATTCTGGAAATGCGGAG | valign="top" |B3 | valign="top" |1.5 | valign="top" |57 |- | valign="top" |FCA664 | valign="top" |AGAAAAATGACTACCGACATGGTT GAGTGCGGCTACTATCTGGG | valign="top" |C1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |56 |- | valign="top" |FCA346 | valign="top" |AATGCCTAGGTAGCACTGTCC CCCAAGTCACCCTCCTGTTG | valign="top" |C2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA920 | valign="top" |CTAGTTGAAGGGGCCAGCAC TCTGTCCAGCCCATAGGTGT | valign="top" |D1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |59 |- | valign="top" |FCA221 | valign="top" |TGGCCCATTAAGCAAGAAGGT TGGCTATGCCAGCAGTTGAA | valign="top" |D3 | valign="top" |1.5 | valign="top" |57 |- | valign="top" |FCA1014 | valign="top" |CTGGCAAGAAGTCCACTGGG CATGGCTCCTGAGGTCATGT | valign="top" |E3 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA1015 | valign="top" |CTCCAGTGCCCATACGTTGT TGGCCACAAAGATGGTTGTTC | valign="top" |E3 | valign="top" |1.5 | valign="top" |57 |- | valign="top" |FCA1016 | valign="top" |GTCACTAAGTGGTGACAGAGCA AACGTTTGAAAGGTGTGCCT | valign="top" |F1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |56 |- | valign="top" |FCA1030 | valign="top" |CGCCCGCAAAAAGACTCAAG GGACGCCCACTAGCCAAATA | valign="top" |F1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA1315 | valign="top" |CCTGCATCAGTTGATTCCTTGT GGACCATCAGAATGCAGCTC | valign="top" |F2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |} 表 A.5 实验猫微卫星位点的扩增条件和染色体分布(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |染色体 | valign="top" |Mg2+浓度(mM) | valign="top" |退火温度(℃) |- | valign="top" |FCA823 | valign="top" |AGGGTGTGCTAGAACTAGCTGG CATTTAGAGGTTCAGGACTGGG | valign="top" |B1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA770 | valign="top" |TCAAGAGTCTTTGCTCAAGGG TTTACTTAGGACTGACAGGGCA | valign="top" |A1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |56 |- | valign="top" |FCA559 | valign="top" |GCCAAAATGTTCAAGAGTGG TTTTGGCTTGATGAGCATCA | valign="top" |B1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 |- | valign="top" |FCA976 | valign="top" |TCCATTTACCTGGGAAATTCC ACCCTCATGTCTTGGCAATC | valign="top" |D4 | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 |- | valign="top" |FCA1240 | valign="top" |TCCTGATGTGGCAGTTAAACC GCATGCCTTGAACCTTTCAT | valign="top" |D2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA176 | valign="top" |GGAAACTTGGAAAGCAAAACC TCCACAGTTGGAGTTCTTAAGG | valign="top" |A1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA045 | valign="top" |TGAAGAAAAGAATCAGGCTGTG GTATGAGCATCTCTGTGTTCGTG | valign="top" |D4 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA723 | valign="top" |TGAAGGCTAAGGCACGATAGA CGGAAAGATACAGGAAGGGTA | valign="top" |A1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA085 | valign="top" |GGTCCTCACGTTTTCCT ATGTCTGTATGAGATGCGGT | valign="top" |E2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA084 | valign="top" |TAGGTGAATGTTGGGATTTATGG AACTGAAGACCAAATTGATGAG | valign="top" |A1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |55 |- | valign="top" |FCA210 | valign="top" |TGAGCCACCTAGGCACTCTT AGAAGCATCCAGTGACAATGG | valign="top" |B4 | valign="top" |1.5 | valign="top" |59 |- | valign="top" |FCA453 | valign="top" |AATTCTGAGAACAAGCTGAGGG ATCCTCTATGGCAGGACTTTG | valign="top" |A1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |60 |- | valign="top" |FCA672 | valign="top" |AAGTTGCTTGCACACACTGC TCCAAGAGCCTTTTCAGTTAGG | valign="top" |F2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |60 |- | valign="top" |FCA1056 | valign="top" |GGTGTGAGGGCCTATTCTGA GGATGTCTCCCTTGACTGGT | valign="top" |B4 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA1239 | valign="top" |AAAAGCCCTGACACCCAAG CTTGACCTTAATTGCTCATTGG | valign="top" |D2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA700 | valign="top" |CCCTTAAAATCGCAGCTCTG AATCCAAGGAAAACAGGCCT | valign="top" |B1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA742 | valign="top" |TCAATGTCTTGACAACGCATAA AGGATTGCATGACCAGGAAC | valign="top" |D4 | valign="top" |1.5 | valign="top" |56 |- | valign="top" |FCA678 | valign="top" |TCCCTCAGCAATCTCCAGAA GAGGGAGCTAGCTGAAATTGTT | valign="top" |A1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |56 |- | valign="top" |FCA096 | valign="top" |CACGCCAAACTCTATGCTGA CAATGTGCCGTCCAAGAAC | valign="top" |E2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |} 表 A.5 实验猫微卫星位点的扩增条件和染色体分布(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |染色体 | valign="top" |Mg2+浓度(mM) | valign="top" |退火温度(℃) |- | valign="top" |FCA075 | valign="top" |ATGCTAATCAGTGGCATTTGG GAACAAAAATTCCAGACGTGC | valign="top" |E2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA149 | valign="top" |CCTATCAAAGTTCTCACCAAATCA GTCTCACCATGTGTGGGATG | valign="top" |B1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA220 | valign="top" |CGATGGAAATTGTATCCATGG GAATGAAGGCAGTCACAAACTG | valign="top" |F2 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |- | valign="top" |FCA229 | valign="top" |CAAACTGACAAGCTTAGAGGGC GCAGAAGTCCAATCTCAAAGTC | valign="top" |A1 | valign="top" |1.5 | valign="top" |58 |} A.2.6 用于检测实验鸡遗传质量的微卫星位点为29个,各微卫星位点的名称、引物序列、等位基因数和等位基因范围按照表A.6的规定执行。 表A.6 实验鸡微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因 分布范围 |- | valign="top" |MCW0029 | valign="top" |GTGGACACCCATTTGTACCCTATG CATGCAATTCAGGACCGTGCA | valign="top" |63.8 | valign="top" |8 | valign="top" |139~188 |- | valign="top" |ADL0293 | valign="top" |GTAATCTAGAAACCCCATCT ACATACCGCAGTCTTTGTTC | valign="top" |53.9 | valign="top" |6 | valign="top" |106~120 |- | valign="top" |ADL0317 | valign="top" |AGTTGGTTTCAGCCATCCAT CCCAGAGCACACTGTCACTG | valign="top" |58.5 | valign="top" |8 | valign="top" |177~219 |- | valign="top" |GCT0016 | valign="top" |TCCAAGGTTCTCCAGTTC GGCATAAGGATAGCAACAG | valign="top" |52.2 | valign="top" |6 | valign="top" |111~148 |- | valign="top" |ADL0304 | valign="top" |GGGGAGGAACTCTGGAAATG CCTCATGCTTCGTGCTTTTT | valign="top" |53.9 | valign="top" |7 | valign="top" |138~161 |- | valign="top" |LEI0074 | valign="top" |GACCTGGTCCTGACATGGGTG GTTTGCTGATTAGCCATCGCG | valign="top" |58.5 | valign="top" |6 | valign="top" |221~243 |- | valign="top" |ADL328 | valign="top" |CACCCATAGCTGTGACTTTG AAAACCGGAATGTGTAACTG | valign="top" |53.9 | valign="top" |5 | valign="top" |107~120 |- | valign="top" |GGANTECl | valign="top" |GCGGGGCCGTTATCAGAGCA AGTGCAGGGCGCTCCTGGT | valign="top" |65.0 | valign="top" |7 | valign="top" |139~194 |- | valign="top" |LEI0094* | valign="top" |CAGGATGGCTGTTATGCTTCCA CACAGTGCAGAGTGGTGCGA | valign="top" |56.0 | valign="top" |7 | valign="top" |176~211 |- | valign="top" |MCW0330 | valign="top" |TGGACCTCATCAGTCTGACAG AATGTTCTCATAGAGTTCCTGC | valign="top" |58.5 | valign="top" |6 | valign="top" |217~287 |- | valign="top" |LEI0141 | valign="top" |CGCATTTGATGCATAACACATG AAGGCAAACTCAGCTGGAACG | valign="top" |52.2 | valign="top" |5 | valign="top" |221~245 |- | valign="top" |MCW0087 | valign="top" |ATTTCTGCAGCCAACTTGGAG CTCAGGCAGTTCTCAAGAACA | valign="top" |58.5 | valign="top" |9 | valign="top" |268~289 |} 表 A.6 实验鸡微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因 分布范围 |- | valign="top" |MCW0347 | valign="top" |GCTTCCAGATGAGCTCCATGG CACAGCGCTGCAGCAACTG | valign="top" |52.0 | valign="top" |3 | valign="top" |121~149 |- | valign="top" |ADL176 | valign="top" |TTGTGGATTCTGGTGGTAGC TTCTCCCGTAACACTCGTCA | valign="top" |58.5 | valign="top" |9 | valign="top" |183~200 |- | valign="top" |ADL0201 | valign="top" |GCTGAGGATTCAGATAAGAC AATGGCYGACGTTTCACAGC | valign="top" |58.5 | valign="top" |7 | valign="top" |111~151 |- | valign="top" |GGNCAMZO | valign="top" |GTCACTAGGTTAGCAGCATG GCTGGATACAGACCTCGATT | valign="top" |56.0 | valign="top" |1 | valign="top" |234 |- | valign="top" |GGAVIR | valign="top" |AGAGATGGTGCACGCAACCT CGAGCACTTTCTGGCAGAGA | valign="top" |60.7 | valign="top" |3 | valign="top" |86~89 |- | valign="top" |MCW0063 | valign="top" |GGCTCCAAAAGCTTGTTCTTAGCT GAAAACCAGTAAAGCTTCTTAC | valign="top" |53.9 | valign="top" |8 | valign="top" |116~149 |- | valign="top" |ADL185 | valign="top" |CATGGCAGCTGACTCCAGAT AGCGTTACCTGTTCGTTTGC | valign="top" |58.5 | valign="top" |9 | valign="top" |116~142 |- | valign="top" |GGMYC | valign="top" |CGAGGCGCTCTGCGAGTTTA TGGGGACCTCTGGCTCTGAC | valign="top" |62.4 | valign="top" |5 | valign="top" |139~151 |- | valign="top" |LEI0094 | valign="top" |GATCTCACCAGTATGAGCTGC TCTCACACTGTAACACAGTGC | valign="top" |53.9 | valign="top" |6 | valign="top" |250~283 |- | valign="top" |GGVITC | valign="top" |AGCCATCATTCAGGGCATCT GATGTCCTGAGTGATGCTCA | valign="top" |58.5 | valign="top" |2 | valign="top" |86~90 |- | valign="top" |ADL0292 | valign="top" |CCAAATCAGGCAAAACTTCT AAATGGCCTAAGGATGAGGA | valign="top" |58.5 | valign="top" |6 | valign="top" |110~136 |- | valign="top" |GGVITIIG* | valign="top" |GGCAGGTTTCTAATGCCTGA CCCATCGTTTCAACTGTATG | valign="top" |56.0 | valign="top" |2 | valign="top" |186~189 |- | valign="top" |ADL166 | valign="top" |TGCCAGCCCGTAATCATAGG AAGCACCACGACCCAATCTA | valign="top" |58.5 | valign="top" |6 | valign="top" |131~154 |- | valign="top" |MCW0014 | valign="top" |AAAATATTGGCTCTAGGAACTGTC ACCGGAAATGAAGGTAAGACTAGC | valign="top" |58.5 | valign="top" |9 | valign="top" |172~195 |- | valign="top" |GGCYMA* | valign="top" |AGCGAGGCGCTCTGCGAGTT GGGCACCTCTGGCTCTGACC | valign="top" |64.6 | valign="top" |5 | valign="top" |140~153 |- | valign="top" |MCW0402 | valign="top" |ACTGTGCCTAGGACTAGCTG CCTAAGTCTGGGCTCTTCTG | valign="top" |56.0 | valign="top" |15 | valign="top" |141~229 |- | valign="top" |STMSGGHU2-1A | valign="top" |CTTAATATGTGTGAGGTGGC GTTCTCACAATTGCATTAGC | valign="top" |53.9 | valign="top" |2 | valign="top" |235~238 |} A.2.7 用于检测实验鸭遗传质量的微卫星位点为29个,各微卫星位点的名称、引物序列、等位基因数和等位基因范围按照表A.7的规定执行。 表A.7 实验鸭微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因 分布范围 |- | valign="top" |APL2 | valign="top" |GATTCAACCTTAGCTATCAGTCTCC CGCTCTTGGCAAATGTCC | valign="top" |58.5 | valign="top" |4 | valign="top" |115~125 |- | valign="top" |APL579 | valign="top" |ATTAGAGCAGGAGTTAGGAGAC GCAAGAAGTGGCTTTTTTC | valign="top" |55 | valign="top" |7 | valign="top" |118~227 |- | valign="top" |APH09 | valign="top" |GGATGTTGCCCCACATATTT TTGCCTTGTTTATGAGCCATTA | valign="top" |58 | valign="top" |8 | valign="top" |93~188 |- | valign="top" |APH11 | valign="top" |GGACCTCAGGAAAATCAGTGTA GCAGGCAGAGCAGGAAATA | valign="top" |58.5 | valign="top" |2 | valign="top" |183~185 |- | valign="top" |APH18 | valign="top" |TTCTGGCCTGATAGGTATGAG GAATTGGGTGGTTCATACTGT | valign="top" |58 | valign="top" |3 | valign="top" |179~324 |- | valign="top" |AY258 | valign="top" |ATGTCTGAGTCCTCGGAGC ACAATAGATTCCAGATGCTGAA | valign="top" |58.1 | valign="top" |9 | valign="top" |90~161 |- | valign="top" |AY264 | valign="top" |GCAGACTTTTACTTATGACTC CTTAGCCCAGTGAAGCATG | valign="top" |58.1 | valign="top" |11 | valign="top" |112~328 |- | valign="top" |AY314 | valign="top" |CTCATTCCAATTCCTCTGTA CAGCATTATTATTTCAGAAGG | valign="top" |50.3 | valign="top" |3 | valign="top" |135~250 |- | valign="top" |CAUD001 | valign="top" |ACAGCTTCAGCAGACTTAGA GCAGAAAGTGTATTAAGGAAG | valign="top" |55.5 | valign="top" |2 | valign="top" |234~390 |- | valign="top" |CAUD002 | valign="top" |CTTCGGTGCCTGTCTTAGC AGCTGCCTGGAGAAGGTCT | valign="top" |60.8 | valign="top" |4 | valign="top" |175~231 |- | valign="top" |CAUD004 | valign="top" |TCCACTTGGTAGACCTTGAG TGGGATTCAGTGAGAAGCCT | valign="top" |60.8 | valign="top" |3 | valign="top" |162~290 |- | valign="top" |CAUD005 | valign="top" |CTGGGTTTGGTGGAGCATAA TACTGGCTGCTTCATTGCTG | valign="top" |60.8 | valign="top" |3 | valign="top" |180~300 |- | valign="top" |CAUD006 | valign="top" |ATGGTTCTCTGTAGGCAATC TTCTGCTTGGGCTCTTGGA | valign="top" |63.5 | valign="top" |8 | valign="top" |183~248 |- | valign="top" |CAUD007 | valign="top" |ACTTCTCTTGTAGGCATGTCA CACCTGTTGCTCCTGCTGT | valign="top" |60.8 | valign="top" |6 | valign="top" |100~208 |- | valign="top" |CAUD010 | valign="top" |GGATGTGTTTTTCATTATTGAT AGAGGCATAAATACTCAGTG | valign="top" |50.3 | valign="top" |9 | valign="top" |180~300 |- | valign="top" |CAUD011 | valign="top" |TGCTATCCACCCAATAAGTG CAAAGTTAGCTGGTATCTGC | valign="top" |50.3 | valign="top" |6 | valign="top" |137~222 |- | valign="top" |CAUD012 | valign="top" |ATTGCCTTTCAGTGGAGTTTC CGGCTCTAAACACATGAATG | valign="top" |63.5 | valign="top" |9 | valign="top" |182~286 |- | valign="top" |CAUD014 | valign="top" |CACAACTGACGGCACAAAGT CTGAGTTTTTCCCGCCTCTA | valign="top" |58.1 | valign="top" |3 | valign="top" |136~200 |- | valign="top" |CAUD026 | valign="top" |ACGTCACATCACCCCACAG CTTTGCCTCTGGTGAGGTTC | valign="top" |60.8 | valign="top" |9 | valign="top" |134~196 |} 表 A.7 实验鸭微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因 分布范围 |- | valign="top" |CAUD027 | valign="top" |AGAAGGCAGGCAAATCAGAG TCCACTCATAAAAACACCCACA | valign="top" |66 | valign="top" |5 | valign="top" |100~180 |- | valign="top" |CAUD028 | valign="top" |TACACCCAAGTTTATTCTGAG ACTCTCCAGGGCACTAGG | valign="top" |55.5 | valign="top" |8 | valign="top" |153~220 |- | valign="top" |CAUD031 | valign="top" |AGCATCTGGACTTTTTCTGGA CACCCCAGGCTCTGAGATAA | valign="top" |51.4 | valign="top" |10 | valign="top" |140~187 |- | valign="top" |CAUD032 | valign="top" |GAAACCAACTGAAAACGGGC CCTCCTGCGTCCCAATAAG | valign="top" |58.1 | valign="top" |9 | valign="top" |96~206 |- | valign="top" |CAUD034 | valign="top" |TACTGCATATCACTAGAGGA TAGGCATACTCGGGTTTAG | valign="top" |55.5 | valign="top" |9 | valign="top" |160~296 |- | valign="top" |CAUD035 | valign="top" |GTGCCTAACCCTGATGGATG CTTATCAGATGGGGCTCGGA | valign="top" |63.5 | valign="top" |7 | valign="top" |174~282 |- | valign="top" |CMO211 | valign="top" |GGATGTTGCCCCACATATTT TTGCCTTGTTTATGAGCCATT | valign="top" |55 | valign="top" |7 | valign="top" |112~205 |- | valign="top" |CMO212 | valign="top" |CTCCACTAGAACACAGACATT CATCTTTGGCATTTTGAAG | valign="top" |58 | valign="top" |3 | valign="top" |186~272 |} A.2.8 用于检测实验鹅遗传质量的微卫星位点为14个,各微卫星位点的名称、引物序列、等位基因数和等位基因范围按照表A.8的规定执行。 表A.8 实验鹅微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因 分布范围 |- | valign="top" |Ans02 | valign="top" |TTCTGTGCAGGGGCGAGTT AGGGAACCGATCACGACATG | valign="top" |58 | valign="top" |7 | valign="top" |202~230 |- | valign="top" |Ans07 | valign="top" |GACTGAGGAACTACAATTGACT ACAAAGACTACTACTGCCAAG | valign="top" |58 | valign="top" |6 | valign="top" |236~246 |- | valign="top" |Ans02 | valign="top" |TTCTGTGCAGGGGCGAGTT AGGGAACCGATCACGACATG | valign="top" |58 | valign="top" |7 | valign="top" |202~230 |- | valign="top" |Ans07 | valign="top" |GACTGAGGAACTACAATTGACT ACAAAGACTACTACTGCCAAG | valign="top" |58 | valign="top" |6 | valign="top" |236~246 |- | valign="top" |Ans17 | valign="top" |ACAAATAACTGGTTCTAAGCAC AGAGGACTTCTATTCATAAATA | valign="top" |54 | valign="top" |4 | valign="top" |111~123 |- | valign="top" |Ans18 | valign="top" |GTGTTCTCTGTTTATGATATTAC AACAGAATTTGCTTGAAACTGC | valign="top" |58 | valign="top" |3 | valign="top" |229~237 |- | valign="top" |CKW47 | valign="top" |AACTTCTGCACCTAAAAACTGTCA TGCTGAGGTAACAGGAATTAAAA | valign="top" |62 | valign="top" |6 | valign="top" |211~221 |- | valign="top" |APH13 | valign="top" |CAACGAGTGACAATGATAAAA CAATGATCTCACTCCCAATAG | valign="top" |55 | valign="top" |4 | valign="top" |163~178 |} 表 A.8 实验鹅微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因 分布范围 |- | valign="top" |APH20 | valign="top" |ACCAGCCTAGCAAGCACTGT GAGGCTTTAGGAGAGATTGAAAAA | valign="top" |60 | valign="top" |13 | valign="top" |135~155 |- | valign="top" |Bca μ5 | valign="top" |AGTGTTTCTTTCATCTCCACAAGC AGACCACAATCGGACCACATATTC | valign="top" |62 | valign="top" |4 | valign="top" |197~201 |- | valign="top" |Bca μ8 | valign="top" |CCCAAGACTCACAAAACCAGAAAT ATGAAAGAAGAGTTAAACGTGTGCAA | valign="top" |58 | valign="top" |7 | valign="top" |155~164 |- | valign="top" |TTUCG1 | valign="top" |CCCTGCTGGTATACCTGA GTGTCTACACAACAGC | valign="top" |58 | valign="top" |3 | valign="top" |113~115 |- | valign="top" |G-Ans25 | valign="top" |CACTTATTAATGGCACTTGAAA GTTCTCTTGTCACAACTGGA | valign="top" |62 | valign="top" |4 | valign="top" |224~270 |- | valign="top" |G-Hhiμ1b¶ | valign="top" |ATCAAAGGCACAATGTGAAAT AGTAAGGGGGCTTCCACC | valign="top" |60 | valign="top" |6 | valign="top" |163~221 |- | valign="top" |G-Bcaμ7 | valign="top" |TAGTTTCTATTTGCACCCAATGGAG TAGTTTCTATTTGCACCCAATGGAG | valign="top" |60 | valign="top" |6 | valign="top" |164~174 |- | valign="top" |G-CAUD006 | valign="top" |ATGGTTCTCTGTAGGCAATC TTCTGCTTGGGCTCTTGG | valign="top" |56 | valign="top" |13 | valign="top" |152~210 |} A.2.9 用于检测实验鸽遗传质量的微卫星位点为16个,各微卫星位点的名称、引物序列、等位基因数和等位基因范围按照表A.9的规定执行。 表A.9 实验鸽微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围 {| class="wikitable" | valign="top" |位点名称 | valign="top" |引物序列(5′~3′) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因 分布范围 |- | valign="top" |UU-Cli02 | valign="top" |TGGGCAAGGTACACTTTTAGGT CTTTATGCTCCCCCTTGAGAT | valign="top" |61 | valign="top" |4 | valign="top" |158~170 |- | valign="top" |UU-Cli06 | valign="top" |TTTGAAAAACATGGATTGTGC AATTTGCAGAGGGTGAGTGG | valign="top" |56 | valign="top" |4 | valign="top" |140~145 |- | valign="top" |PG5 | valign="top" |GTTCTTGGTGTTGCATGGATGC AGTTACGAAATGATTGCCAGAAG | valign="top" |59 | valign="top" |2 | valign="top" |262~266 |- | valign="top" |C26L9(1265223) | valign="top" |CAAAGCTGCTGACGTGAATCAA AGAGACGCTCCATGCAAAAG | valign="top" |59 | valign="top" |4 | valign="top" |467~472 |- | valign="top" |UU-Cli14 | valign="top" |CAGAACGTTTTGTTCTGTTTGG TCTTGCTGCAGTCTTCATCC | valign="top" |58 | valign="top" |5 | valign="top" |265~292 |- | valign="top" |C12L1(532572) | valign="top" |GTTGTTTGGCTGAGTGGACG TCAACCAGGGGAATTGGCAG | valign="top" |62 | valign="top" |3 | valign="top" |126~136 |- | valign="top" |C12L4(906353) | valign="top" |GCTGCTGTCTTCTTCATTGGG TTAAAACCTCCCGTCTCCCTG | valign="top" |60 | valign="top" |5 | valign="top" |210~250 |- | valign="top" |CliµD11 | valign="top" |CCAATCCCAAAGAGGATTAT ACTGTCCTATGGCTGAAGTG | valign="top" |58 | valign="top" |4 | valign="top" |78~98 |} 表 A.9 实验鸽微卫星位点的引物序列、退火温度、等位基因数及等位基因分布范围(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点名称 | valign="top" |引物序列(5′~3′) | valign="top" |退火温度(℃) | valign="top" |最大等位基因数 | valign="top" |等位基因 分布范围 |- | valign="top" |C26L10(1404758) | valign="top" |GCTGTCAGGTATCAGCCACAA TCAGACCCACGAAAGCTGTAA | valign="top" |59 | valign="top" |7 | valign="top" |211~226 |- | valign="top" |C26L4(568923) | valign="top" |CAACCCCATGTGGGTGAGAC CACCACCACGTGGGACATC | valign="top" |63 | valign="top" |6 | valign="top" |357~432 |- | valign="top" |PG4 | valign="top" |CCCATCTCCTGCCTGATGC CACAGCAGGATGCTGCCTGC | valign="top" |64 | valign="top" |4 | valign="top" |136~170 |- | valign="top" |UU-Cli12 | valign="top" |CGCCAGACTGTATTGTGAGC AGCATGGCTGTTCTTTGAGG | valign="top" |61 | valign="top" |9 | valign="top" |231~265 |- | valign="top" |CliμT47 | valign="top" |ATGTGTGTTTGTGCATGAAG ATGAAAGCCTGTTAGTGGAA | valign="top" |56 | valign="top" |5 | valign="top" |183~214 |- | valign="top" |CliμD32 | valign="top" |GAGCCATTTCAGTGAGTGACA GTTTGCAGGAGCGTGTAGAGAAGT | valign="top" |60 | valign="top" |6 | valign="top" |136~158 |- | valign="top" |UU-Cli07 | valign="top" |GCTGCCTGTTACTACCTGAGC CTGGCCATGAAATGAACTCC | valign="top" |61 | valign="top" |4 | valign="top" |277~310 |- | valign="top" |C26L1(20390) | valign="top" |AGGAGCCTACACTGGGTTTTC TGTAGCTCTGCAATCAGCCT | valign="top" |60 | valign="top" |4 | valign="top" |250~268 |} A.2.10 用于检测实验斑马鱼和实验剑尾鱼遗传质量的微卫星位点为5个以上,常用实验斑马鱼品系微卫星分子标记的遗传特征按照表A.10的规定执行。 表A.10 常用实验斑马鱼微卫星分子标记的遗传特征 {| class="wikitable" | rowspan="2" valign="top" |引物名称 | rowspan="2" valign="top" |位点 | rowspan="2" valign="top" |引物序列(5’~3’) | colspan="5" valign="top" |品系片段长度(bp) |- | valign="top" |AB | valign="top" |TU | valign="top" |LF | valign="top" |WIK | valign="top" |本地短尾 |- | valign="top" | Z24 | valign="top" | LG15 | valign="top" |CACCTTCACGGTGAGTAGCA GTGGAATGGTGTGACTAATGTCA | valign="top" | 150 | valign="top" | 150 | valign="top" | 150 | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" | Z928 | valign="top" | LG18 | valign="top" |CAGTCCAGGCTGAACATTCA ACACCTTCGGCAGTTTTCAC | valign="top" | 134,94 | valign="top" | 134,126 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" | Z1059 | valign="top" | LG7 | valign="top" |AACAGGTGACAGAGCACACG GGGAGAGGGCAGGACAATAT | valign="top" | 150/122 | valign="top" | 150/122 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" | Z1265 | valign="top" | LG6 | valign="top" |ATATGTGCTGCTCATGATGAGT AACAGACGAAGGGTGAAGGA | valign="top" | 90~110bp | valign="top" | 90~110bp | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" | Z1637 | valign="top" | LG8 | valign="top" |GGCTTTTGGATGAAGGTTGAGC GGAATCACAATGGCAGCAGA | valign="top" | 143,105 | valign="top" | 133,103 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" | Z3725 | valign="top" | LG3 | valign="top" |ACTAAATCGCACTTCAGCAGCG GGTGTCCTCACATCAGCTGCA | valign="top" |262,256, 248 | valign="top" | 248 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" | Z3782 | valign="top" | LG19 | valign="top" |AATTCTGGGGGGTAATTCTGGC AAGGGGGCTAAACCTTCAACTG | valign="top" |200,90 | valign="top" |170 | valign="top" |120 | valign="top" |90 | valign="top" | |} 表 A.10 常用实验斑马鱼微卫星分子标记的遗传特征(续) {| class="wikitable" | rowspan="2" valign="top" |引物名称 | rowspan="2" valign="top" |位点 | rowspan="2" valign="top" |引物序列(5’~3’) | colspan="5" valign="top" |品系片段长度(bp) |- | valign="top" |AB | valign="top" |TU | valign="top" |LF | valign="top" |WIK | valign="top" |本地短尾 |- | valign="top" | Z4299 | valign="top" | LG5 | valign="top" |AGGAATGCGCTATGGGACGA CACATCTGCCACTGAACCGG | valign="top" |370,260, 230 | valign="top" | 260,230 | valign="top" |280,260 | valign="top" |300, 260, 190 | valign="top" | |- | valign="top" | Z5223 | valign="top" | LG15 | valign="top" |AACAGAGCCGATCTGCCACC AGCACAGCGGAGGAAATAAAGC | valign="top" | 178,150 | valign="top" | 178,150 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" | Z9384 | valign="top" | LG19 | valign="top" |CCGACTGGAGAAGACCTGAG AGCATAATCAGACAACCGGG | valign="top" |134,177, 190,134, 177,190 | valign="top" | | valign="top" |134 , 177,190 134 , 177,190 | valign="top" | | valign="top" |134 , 177 , 190 , 134 , 177,190 |} A.2.11 用于检测封闭群实验树鼩遗传质量的微卫星位点为10个,各微卫星位点的名称、引物序列、P CR反应的退火温度、镁离子浓度按照表A.11的规定执行。 表A.11 实验树鼩微卫星位点的名称、引物序列、PCR 反应的退火温度、镁离子浓度 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | valign="top" |引物序列(5´~3´) | valign="top" |等位基因分布范围 (bp) | valign="top" |等位基因数 | valign="top" |退火温度 (℃) | valign="top" |Mg<sup>2+</sup>浓度 (mM) |- | valign="top" |TBC16 | valign="top" |CCATCCTGACTACTGCTTAC AGGGCTACTTTATAGGTTTC | valign="top" |135-167 | valign="top" |7 | valign="top" |51 | valign="top" |1.5 |- | valign="top" |TBC19 | valign="top" |AGGGAACCAAATGAACAA GTCACCGAAGTCACAACC | valign="top" |196-208 | valign="top" |6 | valign="top" |58 | valign="top" |1.5 |- | valign="top" |TBC23 | valign="top" |GCTTTGTCACTTTCCTTCCCTA TGCGCTCGTGGCTATTTT | valign="top" |166-262 | valign="top" |16 | valign="top" |55 | valign="top" |2.0 |- | valign="top" |TBC25 | valign="top" |TGTCTCCCTGGTCATATT GTGCTCTTCTCAGCGTTT | valign="top" |386-426 | valign="top" |8 | valign="top" |59 | valign="top" |2.0 |- | valign="top" |TBC26 | valign="top" |CATCCCTGAATCCAAGCC CACCAGCAAGGTAACTCC | valign="top" |206-236 | valign="top" |6 | valign="top" |55 | valign="top" |1.5 |- | valign="top" |TBC27 | valign="top" |GTTAAGGCACTGGACATT GTGAACCCACAAATAATCTA | valign="top" |220-246 | valign="top" |3 | valign="top" |57 | valign="top" |1.5 |- | valign="top" |TB6 | valign="top" |AGACAGAATGCAAGAAATCAC ATGTGCAATGTAATAGTTCCAG | valign="top" |418-432 | valign="top" |4 | valign="top" |56 | valign="top" |1.5 |- | valign="top" |TG4 | valign="top" |TGAAAACTGGCAATTCATATGC CAATCCTTTTTCGTTAGTTTTGTG | valign="top" |134-152 | valign="top" |4 | valign="top" |57 | valign="top" |1.5 |- | valign="top" |JS22 | valign="top" |CAATGTCCTGGTGGTTATGG GAAGTGGTCACTCTGCAATCC | valign="top" |149-168 | valign="top" |7 | valign="top" |58 | valign="top" |1.5 |- | valign="top" |JS188 | valign="top" |ACACACACAAAACTCATTTTATCC TCTACACGAATGTGCCAACC | valign="top" |182-190 | valign="top" |5 | valign="top" |58 | valign="top" |1.5 |} A.3 PCR扩增 A.3.1 PCR扩增的体系 PCR总反应体积为15μL,其中含10×PCR buffer:1.5μL,上下游引物(100 pmol/μL) 各1μL, 4×dNTP 100 μmol/L:1μL ,Taq 酶1U:1μL ,50 ng~100 ng 基因组DNA:1μL ,纯水(ddH2O) :8.5μL。 PCR反应程序为:95 ℃预变性,4 min;94 ℃变性,30 s;退火温度(各位点序列、PCR反应条件见表 A.1~A.10),30 s;72 ℃延伸,30 s;35个循环;72 ℃继续延伸7 min;扩增产物4 ℃保存。 A.3.2 PCR产物的凝胶检测 PCR产物经1.5%的琼脂糖凝胶电泳以及凝胶成像系统拍照。 A.3.3 扩增产物的STR扫描 扩增产物经过琼脂糖凝胶电泳检测确保扩增出目的片断后,选择分别以FAM、HEX、TAMRA标记的三 个位点的扩增产物,以1:3:5体积比混合,取1μL上样进行STR扫描。 A.4 STR扫描结果的判读与统计分析 扫描结果可出现两种波形:一种为纯合基因型,只有一个主波;另一种为杂合基因型,有两个主波。 由群体遗传分析软件读出每个样本在每个微卫星位点的扩增片断大小。每个位点的等位基因根据扩 增片断从小到大顺序排列记录为a,b,c,d等。 A.4.1 数据统计分析 将所有样本的每个微卫星位点的基因型以ab,bb等形式运用软件的数据文件,计算样品在各微卫星位点上的基因频率、平均观察等位基因数、平均有效等位基因数(Ne)、香隆指数、平均杂合度(H)等。 A.5 实验结果 A.5.1 实验种群 A.5.1.1 实验狨猴和实验猫 实验狨猴和实验猫采用群体平衡状态方法进行评价。按照哈代-温伯格(Hardy-Weiberg)定律,根据各位点的等位基因数计算封闭群的基因频率,进行卡方(chi-square test)检验。当群体达到平衡状态,该群体判为合格,否则判为不合格。 A.5.1.2 实验雪貂 实验雪貂采用群体平均杂合度进行评价,当群体平均杂合度在0.5~0.7时,该群体判为合格,否则 判为不合格。 A.5.2 封闭群 封闭群实验长爪沙鼠、实验鸡、实验鸭、实验鹅、实验鸽、实验小型猪、实验鱼(斑马鱼和剑尾鱼)和实验树鼩采用平均杂合度进行评价,当群体平均杂合度在0.5~0.7时,该群体判为合格,否则判为不合格。 A.5.3 近交系 A.5.3.1 实验小型猪 所有样品检测位点的等位基因都符合品系的特征,按照表A.12~A.14的规定执行,没有新的等位基因出现为合格实验小型猪近交系,否则判为不合格。 表A.12 近交系五指山小型猪近交系培育过程中遗传质量控制的微卫星座位及优势等位基因 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | colspan="5" valign="top" |等位基因及频率 | valign="top" |频率合计 |- | rowspan="2" valign="top" |CGA | valign="top" |片段 | valign="top" |189 | valign="top" |199 | valign="top" |203 | valign="top" |293 | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.023 | valign="top" |0.872 | valign="top" |0.023 | valign="top" |0.081 | valign="top" |1.000 |- | rowspan="2" valign="top" |SW769 | valign="top" |片段 | valign="top" |105 | valign="top" |129 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.093 | valign="top" |0.907 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.97 |- | rowspan="2" valign="top" |SW857 | valign="top" |片段 | valign="top" |150 | valign="top" |158 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.163 | valign="top" |0.837 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |1 |- | rowspan="2" valign="top" |S0355 | valign="top" |片段 | valign="top" |0.75 | valign="top" |0.138 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |106 | valign="top" |114 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.888 |- | rowspan="2" valign="top" |SW72 | valign="top" |片段 | valign="top" |106 | valign="top" |114 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.588 | valign="top" |0.238 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.825 |- | rowspan="2" valign="top" |S0090 | valign="top" |片段 | valign="top" |241 | valign="top" |247 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.756 | valign="top" |0.012 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.756 |- | rowspan="2" valign="top" |S0218 | valign="top" |片段 | valign="top" |173 | valign="top" |179 | valign="top" |181 | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.012 | valign="top" |0.547 | valign="top" |0.419 | valign="top" | | valign="top" |0.547 |- | rowspan="2" valign="top" |SW24 | valign="top" |片段 | valign="top" |104 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.631 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.631 |} 表A.13 近交系广西巴马小型猪和培育过程中遗传质量控制的微卫星座位及优势等位基因 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | colspan="5" valign="top" |等位基因及频率 | valign="top" |频率合计 |- | rowspan="2" valign="top" |CGA | valign="top" |片段 | valign="top" |271 | valign="top" |277 | valign="top" |297 | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.49 | valign="top" |0.281 | valign="top" |0.229 | valign="top" | | valign="top" |1 |- | rowspan="2" valign="top" |SW769 | valign="top" |片段 | valign="top" |123 | valign="top" |127 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.194 | valign="top" |0.806 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |1 |- | rowspan="2" valign="top" |SW857 | valign="top" |片段 | valign="top" |146 | valign="top" |154 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.146 | valign="top" |0.573 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.719 |- | rowspan="2" valign="top" |S0005 | valign="top" |片段 | valign="top" |216 | valign="top" |226 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.223 | valign="top" |0.66 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.883 |- | rowspan="2" valign="top" |SW240 | valign="top" |片段 | valign="top" |94 | valign="top" |98 | valign="top" |104 | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.531 | valign="top" |0.333 | valign="top" |0.115 | valign="top" | | valign="top" |0.979 |- | rowspan="2" valign="top" |S0355 | valign="top" |片段 | valign="top" |258 | valign="top" |260 | valign="top" |262 | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.083 | valign="top" |0.427 | valign="top" |0.427 | valign="top" | | valign="top" |0.854 |- | rowspan="2" valign="top" |SW72 | valign="top" |片段 | valign="top" |110 | valign="top" |120 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.698 | valign="top" |0.083 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.781 |- | rowspan="2" valign="top" |S0090 | valign="top" |片段 | valign="top" |241 | valign="top" |243 | valign="top" |247 | valign="top" |249 | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.032 | valign="top" |0.117 | valign="top" |0.489 | valign="top" |0.117 | valign="top" |0.606 |} 表 A.13 近交系广西巴马小型猪和培育过程中遗传质量控制的微卫星座位及优势等位基因(续) {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | colspan="5" valign="top" |等位基因及频率 | valign="top" |频率合计 |- | rowspan="2" valign="top" |S0218 | valign="top" |片段 | valign="top" |167 | valign="top" |173 | valign="top" |179 | valign="top" |187 | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.115 | valign="top" |0.74 | valign="top" |0.125 | valign="top" |0.021 | valign="top" |0.854 |- | rowspan="2" valign="top" |SW24 | valign="top" |片段 | valign="top" |102 | valign="top" |104 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.75 | valign="top" |0.021 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.75 |} 表A.14 近交系贵州小型猪培育过程中遗传质量控制的微卫星座位及优势等位基因 {| class="wikitable" | valign="top" |位点 | colspan="7" valign="top" |等位基因及频率 | valign="top" |频率合计 |- | rowspan="2" valign="top" |CGA | valign="top" |片段 | valign="top" |271 | valign="top" |283 | valign="top" |285 | valign="top" |305 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.011 | valign="top" |0.136 | valign="top" |0.364 | valign="top" |0.295 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.795 |- | rowspan="2" valign="top" |SW769 | valign="top" |片段 | valign="top" |105 | valign="top" |121 | valign="top" |129 | valign="top" |133 | valign="top" |139 | valign="top" |145 | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.291 | valign="top" |0.267 | valign="top" |0.093 | valign="top" |0.151 | valign="top" |0.081 | valign="top" |0.116 | valign="top" |0.907 |- | rowspan="2" valign="top" |SW857 | valign="top" |片段 | valign="top" |156 | valign="top" |160 | valign="top" |166 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.167 | valign="top" |0.452 | valign="top" |0.202 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.821 |- | rowspan="2" valign="top" |S0005 | valign="top" |片段 | valign="top" |202 | valign="top" |204 | valign="top" |214 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.558 | valign="top" |0.244 | valign="top" |0.186 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.988 |- | rowspan="2" valign="top" |SW240 | valign="top" |片段 | valign="top" |96 | valign="top" |102 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.227 | valign="top" |0.182 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.409 |- | rowspan="2" valign="top" |S0355 | valign="top" |片段 | valign="top" |252 | valign="top" |254 | valign="top" |272 | valign="top" |274 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.183 | valign="top" |0.098 | valign="top" |0.11 | valign="top" |0.341 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.732 |- | rowspan="2" valign="top" |SW72 | valign="top" |片段 | valign="top" |102 | valign="top" | | valign="top" |112 | valign="top" |118 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.17 | valign="top" | | valign="top" |0.625 | valign="top" |0.045 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.841 |- | rowspan="2" valign="top" |S0090 | valign="top" |片段 | valign="top" |247 | valign="top" |249 | valign="top" |253 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.045 | valign="top" |0.58 | valign="top" |0.375 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.955 |- | rowspan="2" valign="top" |S0218 | valign="top" |片段 | valign="top" |181 | valign="top" |187 | valign="top" |195 | valign="top" |197 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.151 | valign="top" |0.186 | valign="top" |0.023 | valign="top" |0.5 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.709 |- | rowspan="2" valign="top" |SW24 | valign="top" |片段 | valign="top" |100 | valign="top" |104 | valign="top" |108 | valign="top" |112 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" | |- | valign="top" |频率 | valign="top" |0.114 | valign="top" |0.114 | valign="top" |0.216 | valign="top" |0.136 | valign="top" | | valign="top" | | valign="top" |0.466 |} A.5.3.2 实验鱼 近交系实验鱼(斑马鱼和剑尾鱼)检测结果判定按照表A.15的规定执行。 表A.15 近交系实验鱼检测结果判定 {| class="wikitable" | valign="top" |检测结果 | valign="top" |判 断 | valign="top" |处 理 |- | valign="top" |与标准参考位点完全一致 | valign="top" |未发现遗传变异,遗传质量合格 | valign="top" | |- | valign="top" | 有一个位点的分子与标准参考位点不一致 | valign="top" | 可疑 | valign="top" |增加检测位点数目和增加检测方法后重检,确实只有一个标记基因改变可命 名为同源突变系 |- | valign="top" |两个或两个以上位点的标记基因与标准参 考位点不一致 | valign="top" |不合格 | valign="top" |淘汰,重新引种 |} A.6 结果报告 根据判定结果对实验动物群体出具遗传质量检测报告。 附 录 B (规范性) 实验斑马鱼 SNP 遗传标记的检测方法 B.1 基因组DNA的提取 基因组DNA提取方法按照NY/T 1673的规定执行。 B.2 PCR扩增 按照附录A中A.3.1的方法进行。 B.3 SNP标记的检测 取10 μLPCR产物用25 μL的水稀释,并用枪头吹打混匀。然后取1 μL为模板,用表B.1中的引物 进行PCR扩增和产物测序,最后使用PolyPhred 程序软件分析SNP标记的测定结果。 B.4 SNP分子标记的选择及特征 选择位于近交系斑马鱼25对染色体、剑尾鱼24对染色体上的10个以上位点,作为遗传检测的SNP标记。SNP分子标记的名称及常用近交系斑马鱼的SNP分子标记的特征符合表B.1的要求。 表 B.1 常用实验斑马鱼品系 SNP 分子标记位点 {| class="wikitable" | valign="top" |染色体:位点 | valign="top" |SNP ID | valign="top" |AB | valign="top" |TU | valign="top" |引物(5´~3´) | valign="top" |dbSNP ID |- | valign="top" | 01:018595529 | valign="top" | DS043503-5 | valign="top" | T | valign="top" | C | valign="top" |GGCGATTCCTACAATTCTTC GAAAGTCCTGTGTTGAAGGTG | valign="top" |ss49838906 |- | valign="top" | 01:049159399 | valign="top" | DS036502-3 | valign="top" | G | valign="top" | C | valign="top" |GGCACATCGTCATATAATGC ACAATACTGGAATGACACTGG | valign="top" |ss49838640 |- | valign="top" | 02:025012321 | valign="top" | DS042554 | valign="top" | A | valign="top" | G | valign="top" |GAAGTCCATGTTGGCATCTAC AGTGTTGAGAAACGGTCAGG | valign="top" |ss49824928 |- | valign="top" | 02:027720831 | valign="top" | DS040180-3 | valign="top" | T | valign="top" | G | valign="top" |AACACTGGCACGTACACAAG GGGAATCGTGAACTCGTAAC | valign="top" |ss49838788 |- | valign="top" | 03:048073042 | valign="top" | DS032197-8 | valign="top" | A | valign="top" | T | valign="top" |TCATTGTAATAGCAGTAATGACG TGCAATGTTTGTTTCAGACC | valign="top" |ss49838454 |- | valign="top" | 03:048073049 | valign="top" | DS032197-7 | valign="top" | G | valign="top" | A | valign="top" |TCATTGTAATAGCAGTAATGACG TGCAATGTTTGTTTCAGACC | valign="top" |ss49838453 |} 表 B.1 常用实验斑马鱼品系 SNP 分子标记位点(续) {| class="wikitable" | valign="top" |染色体:位点 | valign="top" |SNP ID | valign="top" |AB | valign="top" |TU | valign="top" |引物(5´~3´) | valign="top" |dbSNP ID |- | valign="top" | 04:003254191 | valign="top" | DS036864-20 | valign="top" | T | valign="top" | G | valign="top" |CTGCTGTTACTGGGTCAGTG ACTGCATGATAATGCCAAAC | valign="top" |ss49838683 |- | valign="top" |04:003254203 | valign="top" |DS036864-19 | valign="top" |G | valign="top" |A | valign="top" |CTGCTGTTACTGGGTCAGTG ACTGCATGATAATGCCAAAC | valign="top" |ss49838682 |- | valign="top" |05:015736030 | valign="top" |DS002778-2 | valign="top" |T | valign="top" |C | valign="top" |AAACGTGGCAGAAATGAAAC CCCATTTGTAGAAGAATCCAG | valign="top" |ss49837738 |- | valign="top" |05:025044903 | valign="top" |DS009184-1 | valign="top" |T | valign="top" |C | valign="top" |TTGCATTAGAGCCTTATCCTG TGTTCTTATGCTCTGTGACTG | valign="top" |ss49837839 |- | valign="top" |06:001111132 | valign="top" |DS014169-1 | valign="top" |T | valign="top" |G | valign="top" |GAGCAGCGATACTCACACAG TTCACTAGGTAAGACTCTTGAAGC | valign="top" |ss49837929 |- | valign="top" |06:024875905 | valign="top" |DS032220-5 | valign="top" |C | valign="top" |T | valign="top" |TCTCTTTAATGTTGGACTGCTG CCTTTAATCCATAGCCTTAGC | valign="top" |ss49838470 |- | valign="top" |07:018909158 | valign="top" |DS033959 | valign="top" |C | valign="top" |T | valign="top" |GACACATACCTGGCACTCG TCTCCTGAGAAGGATTCCAC | valign="top" |ss49816684 |- | valign="top" |07:019711091 | valign="top" |DS023709 | valign="top" |C | valign="top" |T | valign="top" |CAGTTGAGAAGGGAGAAACG GCTGTTGGGTTGACTTGC | valign="top" |ss49806847 |- | valign="top" |08:010818674 | valign="top" |DS023589-1 | valign="top" |G | valign="top" |A | valign="top" |AGGAAAGACACCATCACTGAG CTTTAGGCGCAATAACAAGG | valign="top" |ss49838126 |- | valign="top" |08:026974745 | valign="top" |DS030842-1 | valign="top" |A | valign="top" |T | valign="top" |TATCTCGGTTAACGGGAGTG GCAGGGATATTTGACTTGAATG | valign="top" |ss49838389 |- | valign="top" |09:050927124 | valign="top" |DS048415-2 | valign="top" |G | valign="top" |A | valign="top" |TTCCCAAATACTGAATCTGC GGATCTGTTCATCGAGGTTC | valign="top" |ss49838964 |- | valign="top" |10:012029287 | valign="top" |DS027483-3 | valign="top" |T | valign="top" |G | valign="top" |CATTTAATAAAGGAATCACTACTCTT AGTCAGTTTACTAACCTTGCTTT | valign="top" |ss49838277 |- | valign="top" |10:012029405 | valign="top" |DS027483-4 | valign="top" |T | valign="top" |C | valign="top" |CATTTAATAAAGGAATCACTACTCTT AGTCAGTTTACTAACCTTGCTTT | valign="top" |ss49838278 |- | valign="top" |11:019554122 | valign="top" |DS025015-3 | valign="top" |A | valign="top" |G | valign="top" |AAAGAGCGTCAAGATGTGTG GCCTAACAGTACCATTCTTGG | valign="top" |ss49838173 |- | valign="top" |11:026314774 | valign="top" |DS033040 | valign="top" |C | valign="top" |T | valign="top" |ATCTCGACAACTCTGCTTCC AGTCCAGCAGAAATTGCAC | valign="top" |ss49815810 |- | valign="top" |20:031443053 | valign="top" |DS053166-2 | valign="top" |G | valign="top" |A | valign="top" |TTAGGACACTCCACCATGAG TGCATGAAGACAGAGCAGAG | valign="top" |ss49839067 |- | valign="top" |21:013840265 | valign="top" |DS028819-10 | valign="top" |G | valign="top" |A | valign="top" |GTCCTTCCTGAAGCACTGAG TGTGAAAGGTTTTACTGTATTTC | valign="top" |ss49838329 |- | valign="top" |21:017891301 | valign="top" |DS023849-2 | valign="top" |C | valign="top" |A | valign="top" |TCTGACACAGGAAATAGTATGG CGAATCATATGGGAGTCGTT | valign="top" |ss49838138 |- | valign="top" |22:002853759 | valign="top" |DS036535-2 | valign="top" |G | valign="top" |T | valign="top" |AACTATGAGGCAGTCCGTTC AACTGATCCGTGAGTTGTCC | valign="top" |ss49838647 |} 表 B.1 常用实验斑马鱼品系 SNP 分子标记位点(续) {| class="wikitable" | valign="top" |染色体:位点 | valign="top" |SNP ID | valign="top" |AB | valign="top" |TU | valign="top" |引物(5´~3´) | valign="top" |dbSNP ID |- | valign="top" |22:022530591 | valign="top" |DS020970-1 | valign="top" |A | valign="top" |T | valign="top" |AAGCTGCTCATGTCACTCG GGGACAGGGTACAGGTAAGG | valign="top" |ss49838044 |- | valign="top" |23:009386243 | valign="top" |DS022349-1 | valign="top" |T | valign="top" |C | valign="top" |GATGAGGACATGAGCTTGG TGACCAAACACCCTTAAATG | valign="top" |ss49838099 |- | valign="top" |23:009386361 | valign="top" |DS022349-7 | valign="top" |A | valign="top" |T | valign="top" |GATGAGGACATGAGCTTGG TGACCAAACACCCTTAAATG | valign="top" |ss49838105 |- | valign="top" |24:017922488 | valign="top" |DS055282-4 | valign="top" |A | valign="top" |G | valign="top" |GAGACGGGCACTGAACAC GGATGTTTGTCACCCAAAG | valign="top" |ss49839131 |- | valign="top" |24:017922536 | valign="top" |DS055282-5 | valign="top" |A | valign="top" |G | valign="top" |GAGACGGGCACTGAACAC GGATGTTTGTCACCCAAAG | valign="top" |ss49839132 |- | valign="top" |25:033544463 | valign="top" |DS024735-2 | valign="top" |A | valign="top" |G | valign="top" |TCTTGACATCGGTGGTGAG TTGTATTGGTGCTGTGACC | valign="top" |ss49838169 |} B.5 实验结果 B.5.1 实验鱼检测结果判定 按照表A.15的规定执行。 B.6 结果报告 根据判定结果对实验动物群体出具遗传质量检测报告。 附 录 C (规范性) MHC 单倍型实验鸡和实验鸭直接测序检测方法 C.1 基因组DNA的提取 基因组DNA提取方法按照NY/T 1673的规定执行。 C.2 PCR扩增引物 PCR扩增引物序列、片段长度及退火温度按表C.1和表C.2的规定执行。 表 C.1 单倍型实验鸡 PCR 遗传检测引物序列表 {| class="wikitable" | valign="top" |扩增片段 | valign="top" |引物 | valign="top" |引物序列 | valign="top" |扩增片段 | valign="top" |退火温度(℃) |- | rowspan="2" valign="top" |片段(1) | valign="top" |1F | valign="top" |5′-CCGTGGGATCCTCAGACC-3′ | rowspan="2" valign="top" |384 bp | rowspan="2" valign="top" |56.4 |- | valign="top" |1R | valign="top" |5′-CGGCACTGCGCCATGGAG-3′ |- | rowspan="2" valign="top" |片段(2) | valign="top" |2F | valign="top" |5′-CTGTGTTTCAGGGTCTCACAC-3′ | rowspan="2" valign="top" |442 bp | rowspan="2" valign="top" |56.4 |- | valign="top" |2R | valign="top" |5′-GCAGGACAAGGTCAGGATC-3′ |} 表 C.2 单倍型实验鸭 PCR 遗传检测引物序列表 {| class="wikitable" | valign="top" |扩增片段 | valign="top" |引物 | valign="top" |引物序列 | valign="top" |扩增片段 | valign="top" |退火温度(℃) |- | rowspan="2" valign="top" |片段 | valign="top" |1F | valign="top" |5′-ATGGAGTTGCTGCCCACCTTGCGCCTG-3′ | rowspan="2" valign="top" |984 bp | rowspan="2" valign="top" |60 |- | valign="top" |1R | valign="top" |5′-TGAAACCCATCAGGCACCATCCCAGGT-3′ |} C.3 PCR扩增 C.3.1 PCR扩增体系 PCR总反应体积为15 μL, 其中含10×PCR buffer:1.5 μL,上下游引物(100 pmol/μL) 各1 μL ,4×dNTP 100μmol/L:1 μL ,Taq 酶1 U:1 μL ,50 ng ~ 100 ng 基因组DNA:1 μL , 纯水 (ddH2O) :8.5 μL。PCR反应程序为:95 ℃预变性,4 min;94 ℃变性,30 s;退火温度(各位点序列、PCR反应条件参见表C.1),30 s;72 ℃延伸,30 s;35个循环;72 ℃继续延伸7 min;扩增产物4 ℃保存。 C.3.2 PCR产物的检测 PCR反应结束后,经琼脂糖凝胶电泳检测,检测合格的PCR产物进行测序。测序结果与标准序列进行 比对分析,计算一致率。 C.4 单倍型MHC实验动物标准结果判定 所有样本序列与参考标准序列比对,一致率达100%,判为合格。 C.5 单倍型MHC实验鸡标准序列 C.5.1 B2单倍型实验鸡标准序列 片段(1) CGTGGGATCCTCAGACCCACACCCGCGGCTCACGGCCCCGCTGCGCTCCGTCCCCGCAGAGCTCCATACCCTGCGGTACATCTCT ACGGCGATGACGGATCCCGGCCCCGGGCAGCCGTGGTACGTGGACGTGGGGTACGTGGACGGGGAACTCTTCACGCACTACAACAGCAC CGCTCGGAGGGCTGTGCCCCGCACCGAGTGGATAGCGGCCAACACGGACCAGCAGTACTGGGACAGAGAGACGCAGATCGCACAGGGCA ATGAGCAGATTGACCGCGAGAACCTGGACATACGGCAGCAGCGCCACAACCAGACCGGCGGTGAGCACGGCCGGGGCCGCGGCTCCGTG GGTGTGGGATGGACTCCATGGCGCAGTGCCG 片段(2) CTGTGTTTCAGGGTCTCACACGGCGCAGTGGATGTACGGCTGTGACATCCTCGAGGACGGCACCATCCGGGGGTATCATCAGATG GCCTGCGATGGGAGAGACTTCATTGCCCTCGCTGAAGACATGAAGACGTTCACTGCAGCAGTTCCAGAGGCAGTTCCCACCAAGAGGAA ATGGGAGGAAGGAGGTTATGCTGAGAGGAAGAAGCAGTACC-TGGAGGAAACCTGCGTGGAGGGGCTGCGGAGATACGTGGAATACGGG AAGGCTGAGCTGGGCAGGAGAGGTGAGCAGGGT--------GGGGGGGGGGC CGCAGTGTGGGGCTGGACGTGGGCCGGGGGC TCAGTGTGGGGAGCTCAGCCCGGCCCTCATTGCCACCCGCCT-GCAGAGCGGCCTGAGGTGCGAGTGTGGGGGAAGGAGGCCGACGGGA TCCTGACCTTGTCCTGC C.5.2 B5单倍型实验鸡标准序列 片段(1) CCGTGGGATCCTCAGACCCCCACCCGCGGCTCACGGCCCCGCTGCGCTCCGCCCCCGCAGAGCTCCATACCCTGCGGTACATCCA TACGGCGATGACGGATCCCGGCCCCGGGCAGCCGTGGTACGTGGACGTGGGGTATGTGGACGGGGAACTCTTCGTGCACTACAACAGCA CCGCGCGGAGGTACGTGCCCCGCACCGAGTGGATGGCGGCCAAGGCGGACCAGCAGTACTGGGATGAACAGACGCAGATCGCACAGGGC AATGAGCGGAGTGTGAAAGTGAGCCTGGACACACTGCAGGAACGATACAACCAGACCGGCGGTGAGCACGGCCGGGGCCGCGGCTCCGT GGGTGTGGGATGGGCTCCATGGCGCAGTGCCG 片段(2) CTGTGTTTCAGGGTCTCACACGGCGCAGTGGATGTACGGCTGTGACATCCTCGAGGACGGCACCATCCGGGGGTATCATCAGGAG GCCTACGATGGGAGAGACTTCATTGCCTTCGACAAAGGCACGATGACGTTCACTGCGGCAGTTCCAGAGGCAGTTCCCACCAAGAGGAA ATGGGAGGAAGGAGGTGTTGCTGAGGGGCGGAAGCAGTACCTGGAGGAAACCTGTGTGGAGTGGCTGCGGAGATACGTGGAATATGGGA AGGCTGAGCTGGGCAGGAGAGGTGAGTGGGGTGGAGGGGGGGCCACGGTGTGGGGCTGGACATGGGGCGGGGGCTCAGCGTGGGGATCT CAGCCCGGCCCTCACTGCCACCCGCCCGCAGAGCGGCCCGAGGTGCGAGTGTGGGGGAAGGAGGCCGACGGGATCCTGACCTTGTCCTG C C.5.3 B13单倍型实验鸡标准序列 片段(1) CCGTGGGATCCTCAGACCCCCACCCGCGGCTCACGGCCCCGCTGCGCTCCGCCCCCGCAGAGCTCCATACCCTGCGGTACATCCA TACGGCGATGACGGATCCCGGCCCCGGGCAGCCGTGGTACGTGGACGTGGGGTATGTGGACGGGGAACTCTTCGTGCACTACAACAGCA CCGCGCGGAGGTACGTGCCCCGCACCGAGTGGATGGCGGCCAAGGCGGACCAGCAGTACTGGGATGGACAGACGCAGATCGGACAGCGC AATGAGCGGAGTGTGAAAGTGAGCCTGGACACACTGCAGGAACGATACAACCAGACCGGCGGTGAGCACGGCCGGGGCCGCGGCTCCGT GGGTGTGGGATGGGCTCCATGGCGCAGTGCCG 片段(2) CTGTGTTTCAGGGTCTCACACGGTGCAGTGGATGTTCGGCTGTGACATCCTCGAGGATGGCACCATCCGGGGGTATCGTCAGGTG GCCTACGATGGGAAAGACTTCATTGCCTTCGACAAAGACATGAAGACGTTCACTGCGGCAGTTCCAGAGGCAGTTCCCACCAAGAGGAA ATGGGAGGAAGGAGGTGTTGCTGAGGGGTGGAAGAGTTACCTGGAGGAAACCTGCGTGGAGTGGCTGCGGAGATACGTGGAATACGGGA AGGCTGAGCTGGGCAGGAGAGGTGAGTGGGGTGGGGGGGGGGCCGCGGTGTGGGGCTGGACGTGGGGCGGGGGCTCAGCGTGGGGAGCT CAGCCCGGCCCTCATTGCCACCTGCCTGCAGAGCGGCCTGAGGTGCGAGTGTGGGGGAAGGAGGCCGACGGGATCCTGACCTTGTCCTG C C.5.4 B15单倍型实验鸡标准序列 片段(1) CGTGGGATCCTCAGACCCCCACCCGCGGCTCACGGCCCCGCTGCGCTCCGCCCCCGCAGAGCTCCATACCCTGCGGTACATCCAT ACGGCGATGACGGATCCCGGCCCCGGGCAGCCGTGGTACGTGGACGTGGGGTATGTGGACGGGGAACTCTTCGTGCACTACAACAGCAC CGCGCGGAGGTACGTGCCCCGCACCGAGTGGATGGCGGCCAAGGCGGACCAGCAGTACTGGGATGGACAGACGCAGATCGGACAGCGCA ATGAGCGGAGTGTGAAAGTGAGCCTGGACACACTGCAGGAACGATACAACCAGACCGGCGGTGAGCACGGCCGGGGCCGCGGCTCCGTG GGTGTGGGATGGGCTCCATGGCGCAGTGCCG 片段(2) CTGTGTTTCAGGGTCTCACACGGTGCAGTGGATGTTCGGCTGTGACATCCTCGAGGATGGCACCATCCGGGGGTATCGTCAGGTG GCCTACGATGGGAAAGACTTCATTGCCTTCGACAAAGACATGAAGACGTTCACTGCGGCAGTTCCAGAGGCAGTTCCCACCAAGAGGAA ATGGGAGGAAGGAGGTGTTGCTGAGGGGTGGAAGAGTTACC-TGGAGGAAACCTGCGTGGAGTGGCTGCGGAGATACGTGGAATACGGG AAGGCTGAGCTGGGCAGGAGAGGTGAGTGGGGT--------GGGGGGGGGGC CGCGGTGTGGGGCTGGACGTGGGGCGGGGGC TCAGCGTGGGGAGCTCAGCCCGGCCCTCATTGCCACCTGCCT-GCAGAGCGGCCCGAGGTGCGAGTGTGGGGGAAGGAGGCCGACGGGA TCCTGACCTTGTCCTGC C.5.5 B19单倍型实验鸡标准序列 片段(1) CCGTGGGATCCTCAGACCCCCACCCGCGGCTCACGGCCCCGCTGCGCTCCGCCCCCGCAGAGCTCCATTCCCTGCGGTACGTCCA TACGGCGATGACGGATCCCGGCCCCGGGCTGCCGTGGTTCGTGGACGTGGGGTACGTGGACGGGGAACTCTTCGTGCACTACAACAGCA CCGCGCGGAGGTACGTGCCCCGCACCGAGTGGATGGCGGCCAACACGGACCAGCAGTACTGGGATGGACAGACGCAGATCGGACAGGGC AATGAGCGGAGTGTGAAAGTGAGCTTGAACACACTGCAGGAACGATACAACCAGACCGGCGGTGAGCACGGCCGGGGCCGCGGCTCCGT GGGTGTGGGATGGGCTCCATGGCGCAGTGCCG 片段(2) CTGTGTTTCAGGGTCTCACACGGTGCAGCTGATGTACGGCTGTGACATCCTCGAGGATGGCACCATCCGGGGGTATCATCAGACA GCCTACGATGGGAGAGACTTCATTGCCTTCGACAAAGGCACGATGACGTTCACTGCGGCAGTTCCAGAGGCAGTTCCCACCAAGAGGAA ATGGGAGGAAGGAGGTGTTGCTGAGAGGTGGAAGAGTTACC-TGGAGGAAACCTGCGTGGAGGGGCTGCGGAGATATGTGGAATACGGG AAGGCTGAGCTGGGCAGGAGAGGTGAGCGGGGTCGGGGTGGGGGGGGGGGGG--CGGACGCAGTGTGGGGCTGGACGTGGGGCGGGGGC TCATCGTGGGGAGCTCAGCCCGGCCCTCACTGCCGCCCACCC-ACAGAGCGGCCTGAGGTGCGAGTGTGGGGGAAGGAGGCTGACGGGA TCCTGACCTTGTCCTGC C.5.6 B21单倍型实验鸡标准序列 片段(1) CCGTGGGATCCTCAGACCCCCACCCGCGGCTCACGGCCCCGCTGCGCTCCGCCCCCGCAGAGCTCCATACCCTGCGGTACATCCA TACGGCGATGACGGATCCCGGCCCCGGGCAGCCGTGGTACGTGGACGTGGGGTATGTGGACGGGGAACTCTTCGTGCACTACAACAGCA CCGCGCGGAGGTACGTGCCCCGCACCGAGTGGATGGCGGCCAAGGCGGACCAGCAGTACTGGGATGGACAGACGCAGATCGGACAGCGC AATGAGCGGAGTGTGAAAGTGAGCCTGGACACACTGCAGGAACGATACAACCAGACCGGCGGTGAGCACGGCCGGGGCCGCGGCTCCGT GGGTGTGGGATGGGCTCCATGGCGCAGTGCCG 片段(2) CTGTGTTTCAGGGTCTCACACGGTGCAGTGGATGTTCGGCTGTGACATCCTCGAGGATGGCACCATCCGGGGGTATCGTCAGGTG GCCTACGATGGGAAAGACTTCATTGCCTTCGACAAAGACATGAAGACGTTCACTGCGGCAGTTCCAGAGGCAGTTCCCACCAAGAGGAA ATGGGAGGAAGGAGGTGTTGCTGAGGGGTGGAAGAGTTACC-TGGAGGAAACCTGCGTGGAGTGGCTGCGGAGATACGTGGAATACGGG AAGGCTGAGCTGGGCAGGAGAGGTGAGTGGGGTGGGGGGGGGGCCGCGGTGTGGGGCTGGACGTGGGGCGGGGGCTCAGCGTGGGGAGC TCAGCCCGGCCCTCATTGCCACCTGCCT-GCAGAGCGGCCCGAGGTGCGAGTGTGGGGGAAGGAGGCCGACGGGATCCTGACCTTGTCC TGC C.6 单倍型MHC实验鸭参考序列 C.6.1 B1单倍型MHC实验鸭参考序列 ATGGAGTTGCTGCCCACCTTGTGCCTGGCCTGTGTCCTGCTCCTGGCTGACCTGGTCGTGCTGGCAGCACTGGCCCGGTTGGCCC CGGCACTGGCCCAGCTGGGTCTAGTGGCCACATGGCTGGAGGCTGGGCTGCGGCTACCAGTGCTGGTGGGAGCTGGGAGGCTGTTGGCC CCCGGAGGACCCCGGGGAGCCCCGGCCCTGGTGAGCCTGGCCCCTGCCACCTTCCTTACCCTGCGGGGCTGCCTGGAGCTGCCTGGGGC TCCACCAGTGCTGCTGGCCATGGCCACACCGTCCTGGCTGGCATTGGCCTATGGGGCAGTCTTGCTGGCCCTGCTCACCTGGACCTCCC TGGCACCTGGGGTGGCCCTGGGGACCAAGGAGGTCAAGTACCAGGCGGCCCTGCACCGGCAGCTGGCCCTGGCCTGGCCTGAGTGGCCC TTCCTCAGCGGAGCCTTCTTCTTCCTCATGCTGGCTGCATTGGGTGAGACCTCCGTGCCCTACTGCACTGGGAAGGCCTTGGATGTCCT CCGTCATGGGGATGGCCCCACTGCCTTTGCTACTGCCATCGGCTTTGTGTGCCTCGCCTCTGCCAGCAGGTAGGGACCCCCAGTTCCTC TCCCAGACCCTGTCCACACCTGGGATGGTGCCTGATGGGTTTCA C.6.2 B2单倍型MHC实验鸭参考序列 ATGGAGTTGCTGCCCACCTTGCGCCTGGCCTGTGTCCTGCTCCTGGCTGACCTGGTCGTGCTGGCAGCACTGGCCCGGTTGGCCC CGGCACTGGCACAGCTGGGTCTGGTGGCCACATGGCTGGAGGCTGGGCTGCGGCTACCAGTGCTGGTGGGAGCTGGGAGGCTGTTGGCC CCCGGAGGACCCCAGGGAGCCGCAGCCCTGGTGAGCCTGGCCCCTGCCACCTTCCTTACCCTGCGGGGCTGCCTGGAGCTGCCTGGGGC TCCACCAGTGCTGCTGGCCATGGCCACACCGTCCTGGCTGGCATTGGCCTATGGGGCAGTCTTGCTGGCCCTGCTCACCTGGACCTCCC TGGCACCTGGGGTGGCCCTGGGGACCAAGGAGGTCAAGTACCAGGCGGCCCTGCGCCGGCAGCTGGCCCTGGCCTGGCCTGAGTGGCCC TTCCTCAGCGGAGCCTTCTTCTGCCTCGTGCTGGCTGCATTGGGTGAGACCTCCGTGCCCTACTGCACTGGGAAGGCCTTAGATGTCCT CCGCCATGGGGACGGCCCCACTGCCTTTGCCACTGCCATCGGCTTTGTGTGCCTCGCCTCTGCCAGCAGGTAGGGACCCCCAGTTCCTC TCCCAGAGCCTGTCCACACCTGGGATGGTGCCTGATGGGTTTCA C.6.3 B3单倍型MHC实验鸭参考序列 ATGGAGTTGCTGCCCACCTTGCGCCTGGCCTGTGTCCTGCTCCTGGCTGACCTGGTGGTGCTCGCAGCACTGGCCCGGTTGGCCC CGGCACTGGCCCAGCTGGGTCTAGTGGCCACATGGTTGGAGGCTGGGCTGCGGCTACCAGTGCTGGTGGGAGCTGGGATGCTGTTGGCC CCCGGAGGACCCCGGGGAGCGGCAGCCCTGGTGAGCCTGGCCCCTGCCACCTTCCTTACCCTGCGGGGCTGCCTGGAGCTGCCTGGGGC TCCACCAGTGCTGCTGGCCATGGCCACACCATCCTGGCTGGCATTGGCCTATGGGGCAGTCTTGCTGGCCCTGCTCACCTGGACCTCCC TGGCACCTGGGGTGGCCCTGGGGACCAAGGAGGTCAAGTACCAGGCGGCCCTGCGCCGGCAGCTGGCCCTGGCCTGGCCTGAGTGGCCC TTCCTCAGCGGAGCCTTCTTCTTCCTCGTGCTGGCTGCATTGGGTGAGACCTCCGTGCCCTACTGCACTGGGAAGGCCTTAGATGTCCT CCGCCATGGGGACGGCCCCACTGCCTTTGCCACTGCCATCGGCTTTGTGTGCCTTGCCTCCGCCAGCAGGTAGGGACCTCCAGTTCCTC TCCCAGACCCTGTCCACACCTGGGATGGTGCCTGATGGGTTTCA C.6.4 B4单倍型MHC实验鸭参考序列 ATGGAGTTGCTGCCCACCTTGCGCCTGGCCTGTGTCCTGCTCCTGGCTGACCTGGTCGTGCTGGCAGCACTGGCCCAGTTGGCCC CGGCACTGGCCCAGCTGGGTCTAGTGGCCACATGGCTGGAGGCTGGGCTGCGGCTACCAGTGCTGGTGGGAGCTGGGATGCTGTTGGCC CCCGGAGGACCCCGGGGAGCCGCGGCCCTGGTGAGCCTGGCCCCTGCCACCTTTCTTACCCTGCGGGGCTGCCTGGAGCTGCCTGGGGC TTCACCAGTGCTGCTAGCCATGGCCACACCGTCCTGGCTGGCATTGGCCTACGGGGCAGTCTTGCTGGCCCTGCTCACCTGGACCTCCC TGGCACCTGGGGTGGCCCTGGGGACCAAGGAGGTCAAGTACCAGGCGGCCCTGCGCCGGCAGCTGGCCCTGGCCTGGCCTGAGTGGCCC TTCCTCAGTGGAGCCTTCTTCTGCCTCGTGCTGGCTGCATTGGGTGAGACCTCCGTGCCCTACTGCACTGGGAAGGCCTTAGATGTCCT CCGCCATGGGGACGGCCCCACTGCCTTTGCCACTGCCATCGGCTTTGTGTGCCTTGCCTCCGCCAGCAGGTAGGGACCCCCAGTTCCTC TCCTAGACCCTGTCCACACCTGGGATGGTGCCTGATGGGTTTCA 参 考 文 献 [1] GB 14925—2023 实验动物 环境及设施 [2] 杨芳,何保丽,何永蜀, 等. 树鼩生化与微卫星标记的初步研究[J].昆明医学院学报, 2010,5: 8-11. [3] 张媛,李晓飞,李振宇, 等. 滇西亚种树鼩微卫星分子标记的筛选[J].中国比较医学杂志, 2015,25: 36-41. [4] Fan Y, Huang ZY, Cao CC, et al. 2013. Genome of the Chinese tree shrew[J]. Nature communications, 4:1426. [5] Liu XH, Yao YG. Characterization of 12 polymorphic microsatellite markers in the Chinese tree shrew (Tupaia belangeri chinensis) [J],2013, 34(E2):E62-8. [6] Xu L, Chen SY, Nie WH, et al. Evaluating the phylogenetic position of Chinese tree shrew ( Tupaia belangeri chinensis) based on complete mitochondrial genome: implication for using tree shrew as an alternative experimental animal to primate in biomedical research[J]. J Genet Genomics,2012, 39( 3) : 131-137. [[分类:实验动物标准(北京地标)]] [[分类:标准一览表]]
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